More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_4485 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  64.69 
 
 
928 aa  1185    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  64.69 
 
 
928 aa  1185    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  46.23 
 
 
1022 aa  838    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  46.09 
 
 
891 aa  782    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  61.28 
 
 
915 aa  1104    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.68 
 
 
926 aa  643    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  42.89 
 
 
941 aa  695    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  91.54 
 
 
922 aa  1739    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  58.57 
 
 
906 aa  1062    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  51.1 
 
 
946 aa  939    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  43.2 
 
 
949 aa  693    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  59.4 
 
 
936 aa  1098    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  61.45 
 
 
934 aa  1180    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  43.85 
 
 
979 aa  735    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  89.8 
 
 
922 aa  1706    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  57.58 
 
 
925 aa  1046    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.75 
 
 
893 aa  641    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  40.18 
 
 
1020 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  44.24 
 
 
915 aa  702    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  54.64 
 
 
926 aa  962    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  57.02 
 
 
896 aa  1031    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  56.69 
 
 
896 aa  1027    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  58.12 
 
 
921 aa  1048    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  47.82 
 
 
956 aa  830    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  53.01 
 
 
906 aa  936    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  99.67 
 
 
921 aa  1880    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  43.05 
 
 
968 aa  715    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  52.16 
 
 
941 aa  952    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  81.78 
 
 
930 aa  1555    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  52.68 
 
 
907 aa  930    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  40.2 
 
 
1010 aa  652    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  54.87 
 
 
923 aa  958    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  54.98 
 
 
923 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  56.09 
 
 
903 aa  1045    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  57.42 
 
 
935 aa  1069    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  43.58 
 
 
937 aa  720    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  46.99 
 
 
891 aa  833    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  54.52 
 
 
917 aa  924    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.93 
 
 
945 aa  652    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  54.64 
 
 
926 aa  962    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  61.37 
 
 
916 aa  1149    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  43.37 
 
 
937 aa  718    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  46.14 
 
 
892 aa  765    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  57.8 
 
 
939 aa  1056    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  44.09 
 
 
978 aa  739    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  49.31 
 
 
936 aa  865    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  54.87 
 
 
923 aa  959    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  62.03 
 
 
931 aa  1127    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  54.8 
 
 
905 aa  973    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  42.78 
 
 
924 aa  683    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  45.47 
 
 
892 aa  785    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  55.02 
 
 
926 aa  964    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  42.45 
 
 
945 aa  674    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  44.34 
 
 
929 aa  722    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  49.11 
 
 
957 aa  874    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  63.92 
 
 
926 aa  1177    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  60.07 
 
 
908 aa  1099    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  58.45 
 
 
910 aa  1019    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  50.32 
 
 
944 aa  895    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  54.4 
 
 
913 aa  941    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  84.69 
 
 
921 aa  1605    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  49.74 
 
 
941 aa  874    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  61.35 
 
 
928 aa  1117    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  99.67 
 
 
935 aa  1882    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  47.7 
 
 
988 aa  838    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  52.87 
 
 
934 aa  945    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  55.62 
 
 
904 aa  972    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  43.48 
 
 
935 aa  736    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  41.56 
 
 
937 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  54.89 
 
 
917 aa  925    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  61.3 
 
 
917 aa  1119    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  62.61 
 
 
928 aa  1195    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  42.54 
 
 
978 aa  717    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  41.08 
 
 
946 aa  667    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  57.28 
 
 
951 aa  1088    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  89.92 
 
 
922 aa  1706    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  90.58 
 
 
922 aa  1708    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  57.3 
 
 
912 aa  1020    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  82.95 
 
 
918 aa  1579    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  61.39 
 
 
915 aa  1104    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  44.41 
 
 
928 aa  741    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  55.42 
 
 
917 aa  937    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  61.5 
 
 
913 aa  1117    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  51.31 
 
 
943 aa  933    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  51.65 
 
 
937 aa  919    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  54.64 
 
 
926 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  52.37 
 
 
922 aa  907    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  54.89 
 
 
917 aa  925    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.54 
 
 
902 aa  657    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  43.76 
 
 
911 aa  716    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  90.67 
 
 
922 aa  1731    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  54.64 
 
 
926 aa  962    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  43.36 
 
 
893 aa  731    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.26 
 
 
946 aa  664    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  43.63 
 
 
940 aa  708    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  52.56 
 
 
927 aa  911    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  81.37 
 
 
923 aa  1559    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  62.3 
 
 
930 aa  1150    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  63.9 
 
 
938 aa  1219    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  43.25 
 
 
937 aa  711    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>