More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aasi_0323 on replicon NC_010830
Organism: Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  39.45 
 
 
968 aa  646    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  41.09 
 
 
929 aa  645    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  42.75 
 
 
891 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  41.61 
 
 
915 aa  638    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  48.45 
 
 
926 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  41.11 
 
 
942 aa  668    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.9 
 
 
893 aa  691    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  41.38 
 
 
906 aa  657    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  41.48 
 
 
936 aa  655    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  47.93 
 
 
924 aa  833    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.49 
 
 
979 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.04 
 
 
928 aa  649    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  49.22 
 
 
956 aa  942    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.89 
 
 
928 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.09 
 
 
896 aa  643    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.83 
 
 
896 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  39.73 
 
 
956 aa  649    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.59 
 
 
893 aa  686    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  39.36 
 
 
992 aa  637    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  40.08 
 
 
941 aa  663    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  39.54 
 
 
957 aa  665    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  41.85 
 
 
928 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  40.96 
 
 
944 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  56 
 
 
963 aa  1094    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.85 
 
 
903 aa  679    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  100 
 
 
936 aa  1928    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  44.69 
 
 
891 aa  755    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.72 
 
 
915 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.89 
 
 
945 aa  681    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.78 
 
 
892 aa  699    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40.41 
 
 
924 aa  673    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  39.52 
 
 
1024 aa  639    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.68 
 
 
892 aa  678    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  41.48 
 
 
939 aa  670    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  40.12 
 
 
932 aa  639    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  40.19 
 
 
979 aa  645    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  41.17 
 
 
930 aa  647    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.08 
 
 
930 aa  636    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  41.56 
 
 
931 aa  655    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  42.16 
 
 
928 aa  655    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  39.87 
 
 
943 aa  672    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  51.12 
 
 
932 aa  932    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  42.48 
 
 
950 aa  702    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  58.55 
 
 
1024 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  653    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.69 
 
 
926 aa  638    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  41.46 
 
 
929 aa  650    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  39.38 
 
 
1022 aa  649    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  41.73 
 
 
908 aa  642    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.5 
 
 
928 aa  636    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.08 
 
 
892 aa  674    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  39.77 
 
 
988 aa  649    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  40.25 
 
 
934 aa  653    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  39.84 
 
 
978 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  41.8 
 
 
928 aa  643    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  42.41 
 
 
932 aa  685    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  43.5 
 
 
892 aa  721    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.66 
 
 
928 aa  642    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  56.89 
 
 
946 aa  1095    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.65 
 
 
934 aa  639    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  41.34 
 
 
939 aa  668    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.62 
 
 
951 aa  648    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  54.05 
 
 
939 aa  1031    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.26 
 
 
888 aa  677    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.15 
 
 
928 aa  652    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.49 
 
 
912 aa  645    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  45.34 
 
 
945 aa  846    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  48.63 
 
 
949 aa  932    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.88 
 
 
915 aa  638    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  42.41 
 
 
932 aa  684    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  39.77 
 
 
937 aa  639    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  42.48 
 
 
936 aa  721    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  40.08 
 
 
976 aa  659    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  41.88 
 
 
928 aa  638    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.89 
 
 
928 aa  642    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  41.07 
 
 
943 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  52.39 
 
 
939 aa  978    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.61 
 
 
892 aa  694    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  40.5 
 
 
937 aa  649    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  42.42 
 
 
911 aa  685    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.08 
 
 
903 aa  646    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.89 
 
 
908 aa  645    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.58 
 
 
893 aa  681    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.32 
 
 
946 aa  687    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  42.41 
 
 
932 aa  684    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.83 
 
 
902 aa  632  1e-180  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.09 
 
 
915 aa  633  1e-180  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  40.37 
 
 
935 aa  634  1e-180  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  38.59 
 
 
978 aa  635  1e-180  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.04 
 
 
946 aa  630  1e-179  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  39.72 
 
 
902 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  39.98 
 
 
924 aa  629  1e-179  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.91 
 
 
930 aa  631  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40.67 
 
 
923 aa  630  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>