More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_0543 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  58.37 
 
 		 939 aa  733    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  100 
 
 		 1024 aa  2105    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  53.76 
 
 		 956 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  62.52 
 
 		 946 aa  823    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  52.98 
 
 		 932 aa  671    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  56.86 
 
 		 939 aa  750    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  61.67 
 
 		 963 aa  1258    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  55.27 
 
 		 949 aa  713    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  58.55 
 
 		 936 aa  739    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 943 aa  628  1e-178  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 1024 aa  626  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 942 aa  622  1e-176  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 965 aa  617  1e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 1047 aa  614  9.999999999999999e-175  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 1060 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 1047 aa  615  9.999999999999999e-175  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 1047 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  50 
 
 		 926 aa  603  1.0000000000000001e-171  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 1000 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 1043 aa  602  1e-170  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 972 aa  594  1e-168  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  50.08 
 
 		 924 aa  587  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 1021 aa  588  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  34.94 
 
 		 999 aa  580  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  33.94 
 
 		 1033 aa  581  1e-164  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  47.78 
 
 		 945 aa  564  1.0000000000000001e-159  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  47.93 
 
 		 924 aa  551  1e-155  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 1014 aa  550  1e-155  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  47.68 
 
 		 891 aa  540  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  33.88 
 
 		 1010 aa  539  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  47.18 
 
 		 944 aa  531  1e-149  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  45.26 
 
 		 946 aa  526  1e-148  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  43.37 
 
 		 896 aa  519  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  45.83 
 
 		 945 aa  523  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  44.98 
 
 		 926 aa  522  1e-146  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  45.41 
 
 		 936 aa  522  1e-146  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  44.68 
 
 		 903 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  45.96 
 
 		 939 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  45.35 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  45.66 
 
 		 892 aa  519  1.0000000000000001e-145  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  45.08 
 
 		 929 aa  513  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 893 aa  514  1e-144  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  43.2 
 
 		 896 aa  516  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  45.47 
 
 		 930 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  45.65 
 
 		 924 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  513  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  46.36 
 
 		 923 aa  514  1e-144  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  45.14 
 
 		 933 aa  511  1e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  45.5 
 
 		 943 aa  510  1e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  43.19 
 
 		 893 aa  513  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  512  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 928 aa  512  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 922 aa  510  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  44.74 
 
 		 893 aa  512  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  45.98 
 
 		 931 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  44.81 
 
 		 936 aa  509  9.999999999999999e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 921 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  45.87 
 
 		 903 aa  507  9.999999999999999e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 934 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 928 aa  509  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  44.59 
 
 		 921 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  45.18 
 
 		 888 aa  503  1e-141  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  44.59 
 
 		 921 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  43.59 
 
 		 945 aa  503  1e-141  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  43.21 
 
 		 921 aa  503  1e-141  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  44.2 
 
 		 928 aa  505  1e-141  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  45.58 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  44.75 
 
 		 935 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  42.1 
 
 		 951 aa  504  1e-141  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  45.24 
 
 		 922 aa  506  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  45.07 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  44.33 
 
 		 918 aa  503  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  41.21 
 
 		 957 aa  503  1e-141  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  44.41 
 
 		 891 aa  501  1e-140  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  42.58 
 
 		 932 aa  499  1e-140  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.78 
 
 		 892 aa  501  1e-140  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  44.21 
 
 		 930 aa  502  1e-140  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  46.11 
 
 		 930 aa  500  1e-140  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  45.33 
 
 		 950 aa  502  1e-140  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  44.07 
 
 		 934 aa  501  1e-140  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  43.51 
 
 		 908 aa  500  1e-140  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  42.58 
 
 		 932 aa  499  1e-140  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.56 
 
 		 906 aa  498  1e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  43.77 
 
 		 922 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  44.41 
 
 		 929 aa  499  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 916 aa  499  1e-139  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 932 aa  498  1e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  44.9 
 
 		 934 aa  494  9.999999999999999e-139  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  43.93 
 
 		 944 aa  495  9.999999999999999e-139  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  45.01 
 
 		 939 aa  495  9.999999999999999e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>