More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3415 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.74 
 
 		 903 aa  656    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 891 aa  648    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 915 aa  641    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  54.2 
 
 		 953 aa  974    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 956 aa  644    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 928 aa  664    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 930 aa  658    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.95 
 
 		 903 aa  656    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 896 aa  640    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 896 aa  643    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 932 aa  646    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  100 
 
 		 965 aa  1945    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 941 aa  640    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 915 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 929 aa  638    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 939 aa  648    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.94 
 
 		 892 aa  645    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 903 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 932 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 926 aa  664    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 893 aa  640    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.84 
 
 		 928 aa  647    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 915 aa  643    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 928 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 951 aa  636    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  60.12 
 
 		 936 aa  1025    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 932 aa  646    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 929 aa  637    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 949 aa  648    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  87.86 
 
 		 972 aa  1683    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.71 
 
 		 926 aa  633  1e-180  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 906 aa  635  1e-180  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.88 
 
 		 939 aa  633  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.78 
 
 		 915 aa  634  1e-180  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.55 
 
 		 931 aa  632  1e-180  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 932 aa  630  1e-179  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.94 
 
 		 939 aa  631  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  42.44 
 
 		 924 aa  629  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 903 aa  629  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 934 aa  628  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 946 aa  623  1e-177  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.65 
 
 		 892 aa  622  1e-177  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 888 aa  625  1e-177  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  39.92 
 
 		 930 aa  624  1e-177  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  40.73 
 
 		 899 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 937 aa  619  1e-176  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.96 
 
 		 893 aa  620  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  40.73 
 
 		 899 aa  619  1e-176  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 930 aa  620  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 934 aa  621  1e-176  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  39.9 
 
 		 947 aa  620  1e-176  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 928 aa  620  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.05 
 
 		 912 aa  621  1e-176  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 913 aa  620  1e-176  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.61 
 
 		 928 aa  621  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 915 aa  615  1e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 1024 aa  617  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.5 
 
 		 928 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 943 aa  616  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 937 aa  616  1e-175  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.3 
 
 		 923 aa  616  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 930 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  39.84 
 
 		 931 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 934 aa  615  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 928 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 917 aa  614  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 911 aa  612  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 917 aa  612  1e-173  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 905 aa  611  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.42 
 
 		 921 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 921 aa  610  1e-173  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 918 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  38.83 
 
 		 906 aa  608  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 907 aa  608  9.999999999999999e-173  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 978 aa  607  9.999999999999999e-173  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 921 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 923 aa  605  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 935 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.05 
 
 		 933 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 922 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  40.06 
 
 		 908 aa  605  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  39.44 
 
 		 904 aa  607  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 946 aa  607  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 979 aa  604  1.0000000000000001e-171  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  39.43 
 
 		 937 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.61 
 
 		 926 aa  605  1.0000000000000001e-171  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>