More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_0357 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 928 aa  730    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 928 aa  730    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  43.26 
 
 		 928 aa  729    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  42.65 
 
 		 932 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  41.43 
 
 		 915 aa  696    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.37 
 
 		 915 aa  697    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  41.24 
 
 		 934 aa  689    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  56.12 
 
 		 940 aa  654    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 947 aa  680    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 923 aa  670    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 946 aa  694    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  42.3 
 
 		 937 aa  681    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  40.49 
 
 		 936 aa  672    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  41.37 
 
 		 927 aa  676    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  61.46 
 
 		 979 aa  1225    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 916 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  42.65 
 
 		 932 aa  711    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  56.15 
 
 		 973 aa  1065    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  39.78 
 
 		 930 aa  651    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.74 
 
 		 930 aa  696    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 926 aa  672    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  61.76 
 
 		 976 aa  1232    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 935 aa  661    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 921 aa  667    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 917 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  62.11 
 
 		 1000 aa  1225    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  41.58 
 
 		 943 aa  688    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  43.25 
 
 		 941 aa  701    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  77.05 
 
 		 1020 aa  1536    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 921 aa  660    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  100 
 
 		 1010 aa  2069    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0448  DNA polymerase I  40.61 
 
 		 923 aa  637    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.106408  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 923 aa  673    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  43.47 
 
 		 928 aa  734    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  40.44 
 
 		 935 aa  670    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  54.22 
 
 		 937 aa  1023    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 918 aa  645    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  40.81 
 
 		 917 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  54.79 
 
 		 1047 aa  1067    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 922 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 915 aa  689    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 931 aa  665    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 915 aa  700    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  54.55 
 
 		 1016 aa  1048    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.16 
 
 		 939 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  42.65 
 
 		 932 aa  711    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  54.82 
 
 		 937 aa  1028    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.9 
 
 		 934 aa  697    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 945 aa  651    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 905 aa  677    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  51.21 
 
 		 924 aa  884    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 928 aa  730    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 926 aa  659    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  43.36 
 
 		 928 aa  730    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40 
 
 		 922 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  76.32 
 
 		 1032 aa  1548    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  48.85 
 
 		 945 aa  860    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  61.23 
 
 		 1004 aa  1213    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 934 aa  690    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  42.05 
 
 		 942 aa  684    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1325  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 957 aa  658    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.28 
 
 		 926 aa  725    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  78.71 
 
 		 1021 aa  1576    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 910 aa  654    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 944 aa  674    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  61.36 
 
 		 978 aa  1223    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.24 
 
 		 921 aa  675    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  77.14 
 
 		 1033 aa  1577    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.94 
 
 		 928 aa  708    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  88.77 
 
 		 1014 aa  1788    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 930 aa  688    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  54.12 
 
 		 937 aa  1023    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  57.74 
 
 		 968 aa  1134    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  56.12 
 
 		 935 aa  684    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  47.98 
 
 		 937 aa  822    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 917 aa  636    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  40.73 
 
 		 923 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 928 aa  676    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  61.87 
 
 		 978 aa  1249    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  53.55 
 
 		 1060 aa  1054    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  59.82 
 
 		 979 aa  1158    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  39.4 
 
 		 938 aa  665    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 951 aa  696    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.1 
 
 		 921 aa  663    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  53.15 
 
 		 932 aa  979    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  48.08 
 
 		 941 aa  878    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  43.38 
 
 		 912 aa  743    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  39.88 
 
 		 918 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 926 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  56.63 
 
 		 928 aa  714    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  41.52 
 
 		 917 aa  646    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.82 
 
 		 933 aa  655    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 941 aa  669    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 926 aa  672    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 936 aa  676    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 926 aa  672    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 922 aa  668    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  41.11 
 
 		 917 aa  636    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 923 aa  672    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 911 aa  721    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>