More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_7357 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  697    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 945 aa  644    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  52.7 
 
 		 932 aa  972    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 915 aa  662    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 915 aa  670    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  56.12 
 
 		 973 aa  1048    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.29 
 
 		 923 aa  684    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 932 aa  696    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  62.93 
 
 		 1000 aa  1231    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 946 aa  679    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  697    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 936 aa  638    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  54.6 
 
 		 940 aa  637    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  61.11 
 
 		 979 aa  1208    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  100 
 
 		 1020 aa  2085    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 935 aa  657    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 934 aa  694    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 943 aa  672    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  41.55 
 
 		 937 aa  670    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 930 aa  682    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 896 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  47.9 
 
 		 941 aa  877    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 932 aa  697    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 956 aa  638    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 947 aa  647    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  40 
 
 		 930 aa  663    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 941 aa  689    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 930 aa  654    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 907 aa  649    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  77.04 
 
 		 1010 aa  1571    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 916 aa  672    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  60.42 
 
 		 979 aa  1181    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 918 aa  639    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 935 aa  638    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  54.18 
 
 		 937 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 928 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 933 aa  664    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  54.77 
 
 		 1060 aa  1070    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  41.6 
 
 		 942 aa  670    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 932 aa  696    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  39.96 
 
 		 931 aa  644    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  699    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 		 933 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 939 aa  689    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 922 aa  663    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  54.78 
 
 		 937 aa  1019    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  42.07 
 
 		 934 aa  686    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 937 aa  694    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 905 aa  642    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  51.16 
 
 		 924 aa  884    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  54.74 
 
 		 1047 aa  1070    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3381  DNA polymerase I  59.9 
 
 		 1004 aa  1179    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.30865  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 902 aa  657    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  76.31 
 
 		 1032 aa  1554    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  49.6 
 
 		 945 aa  882    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 915 aa  641    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 928 aa  676    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  39.55 
 
 		 924 aa  652    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5204  DNA polymerase I  76.37 
 
 		 1025 aa  1553    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 926 aa  724    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4857  DNA polymerase I  78.05 
 
 		 1021 aa  1575    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.450809 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1729  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 944 aa  649    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 913 aa  639    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 921 aa  671    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0956  DNA polymerase I  77.51 
 
 		 1033 aa  1582    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 928 aa  694    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  76.99 
 
 		 1014 aa  1559    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 988 aa  650    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 934 aa  670    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  54.07 
 
 		 937 aa  1014    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  38.63 
 
 		 938 aa  648    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  54.37 
 
 		 935 aa  657    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  47.98 
 
 		 937 aa  838    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  59.11 
 
 		 1043 aa  1133    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  61.38 
 
 		 976 aa  1212    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 928 aa  667    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  61.58 
 
 		 978 aa  1235    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  54.2 
 
 		 1016 aa  1047    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1478  DNA polymerase I  39.56 
 
 		 941 aa  635    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.495398 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  40.68 
 
 		 927 aa  652    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  40.1 
 
 		 951 aa  716    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 902 aa  655    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  39.88 
 
 		 922 aa  654    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  60.91 
 
 		 978 aa  1204    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 915 aa  672    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 918 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  697    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  53.3 
 
 		 928 aa  1037    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  41.3 
 
 		 917 aa  636    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 921 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 915 aa  669    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  56.66 
 
 		 968 aa  1104    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 936 aa  637    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  40.08 
 
 		 921 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.34 
 
 		 928 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  54.94 
 
 		 1047 aa  1086    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.23 
 
 		 928 aa  695    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 911 aa  729    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 922 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>