More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_0712 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 922 aa  652    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 924 aa  643    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 891 aa  689    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  48.68 
 
 		 926 aa  880    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 936 aa  637    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 892 aa  662    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 906 aa  635    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  40.27 
 
 		 915 aa  642    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 877 aa  637    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 936 aa  639    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 943 aa  658    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  43.07 
 
 		 928 aa  688    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 922 aa  647    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 928 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0543  DNA polymerase I  50.88 
 
 		 1024 aa  1011    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.72991  normal  0.283494 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  60.57 
 
 		 939 aa  1174    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  55.08 
 
 		 932 aa  1028    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 877 aa  637    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 896 aa  652    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 896 aa  654    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  52.39 
 
 		 936 aa  984    Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  41.71 
 
 		 956 aa  651    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 932 aa  669    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 928 aa  680    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 921 aa  652    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 928 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  41.13 
 
 		 933 aa  639    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 928 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  41.15 
 
 		 930 aa  644    Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.76 
 
 		 934 aa  641    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.72 
 
 		 903 aa  641    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.04 
 
 		 892 aa  658    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  40.56 
 
 		 942 aa  638    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.28 
 
 		 891 aa  743    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  41.48 
 
 		 945 aa  687    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 921 aa  651    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  40 
 
 		 924 aa  682    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  40.34 
 
 		 930 aa  638    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 892 aa  667    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 939 aa  659    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  44.69 
 
 		 924 aa  785    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.36 
 
 		 903 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  40.21 
 
 		 916 aa  636    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  680    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  41.86 
 
 		 931 aa  670    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  42.48 
 
 		 929 aa  691    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  57.78 
 
 		 963 aa  1097    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 935 aa  652    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 936 aa  674    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  53.62 
 
 		 949 aa  1019    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 934 aa  657    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  41.06 
 
 		 915 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 965 aa  650    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  42 
 
 		 926 aa  673    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 892 aa  657    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  41.9 
 
 		 929 aa  678    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2048  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 1022 aa  659    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 944 aa  692    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 921 aa  641    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 928 aa  639    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 950 aa  683    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 988 aa  654    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  42.44 
 
 		 945 aa  647    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 892 aa  697    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  46.02 
 
 		 945 aa  823    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 921 aa  651    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  100 
 
 		 939 aa  1927    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 928 aa  645    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 902 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  56.21 
 
 		 946 aa  1066    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  42.45 
 
 		 951 aa  696    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 934 aa  655    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 922 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 922 aa  649    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 928 aa  662    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 918 aa  642    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 877 aa  642    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.59 
 
 		 902 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 913 aa  642    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 930 aa  642    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 877 aa  639    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  41.13 
 
 		 932 aa  669    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.36 
 
 		 939 aa  644    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.99 
 
 		 911 aa  638    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 922 aa  660    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 917 aa  645    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.33 
 
 		 893 aa  710    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  39.68 
 
 		 946 aa  668    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 932 aa  668    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 923 aa  674    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  41.49 
 
 		 930 aa  654    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 888 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  42.03 
 
 		 928 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 928 aa  681    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>