More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE1637 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 891 aa  654    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.59 
 
 		 926 aa  662    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  100 
 
 		 936 aa  1914    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 892 aa  644    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 929 aa  645    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.51 
 
 		 891 aa  668    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  42.18 
 
 		 926 aa  738    Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.66 
 
 		 929 aa  644    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.38 
 
 		 888 aa  664    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 892 aa  664    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 892 aa  659    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 946 aa  638    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 892 aa  669    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  42.01 
 
 		 908 aa  671    Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 963 aa  645    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 893 aa  640    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 903 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 976 aa  632  1e-180  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 956 aa  634  1e-180  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 893 aa  634  1e-180  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 939 aa  633  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 932 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 979 aa  629  1e-179  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.87 
 
 		 893 aa  632  1e-179  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 949 aa  631  1e-179  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 892 aa  630  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  38.77 
 
 		 939 aa  632  1e-179  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 932 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 930 aa  630  1e-179  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 932 aa  629  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  39.35 
 
 		 978 aa  630  1e-179  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 928 aa  627  1e-178  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 937 aa  626  1e-178  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 928 aa  625  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 937 aa  627  1e-178  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.3 
 
 		 926 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 968 aa  623  1e-177  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 979 aa  620  1e-176  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.77 
 
 		 903 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.37 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 928 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.03 
 
 		 934 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 941 aa  619  1e-175  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 913 aa  616  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 902 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 924 aa  613  9.999999999999999e-175  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 940 aa  613  9.999999999999999e-175  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 924 aa  613  9.999999999999999e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 908 aa  614  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.64 
 
 		 931 aa  615  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  39.08 
 
 		 917 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 896 aa  609  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 903 aa  610  1e-173  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  38.28 
 
 		 931 aa  612  1e-173  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 934 aa  609  1e-173  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.22 
 
 		 936 aa  610  1e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 926 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.79 
 
 		 896 aa  607  9.999999999999999e-173  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 926 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 926 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  37.3 
 
 		 926 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  39 
 
 		 910 aa  607  9.999999999999999e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 915 aa  607  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 930 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 926 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 923 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 939 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 923 aa  602  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 923 aa  603  1.0000000000000001e-171  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  37.79 
 
 		 903 aa  603  1.0000000000000001e-171  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 951 aa  605  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 915 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 943 aa  603  1.0000000000000001e-171  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  37.29 
 
 		 903 aa  602  1e-170  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 934 aa  599  1e-170  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 902 aa  600  1e-170  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 934 aa  601  1e-170  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 933 aa  601  1e-170  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 915 aa  602  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 915 aa  600  1e-170  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 902 aa  601  1e-170  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 911 aa  602  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 946 aa  597  1e-169  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 936 aa  597  1e-169  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 928 aa  597  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  39.33 
 
 		 924 aa  596  1e-169  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 928 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 896 aa  597  1e-169  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 928 aa  598  1e-169  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  38.21 
 
 		 930 aa  598  1e-169  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>