More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SaurJH9_1747 on replicon NC_009487
Organism: Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  43.82 
 
 
873 aa  687    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  83.45 
 
 
876 aa  1520    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43.11 
 
 
888 aa  706    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  57.18 
 
 
877 aa  989    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  46.13 
 
 
896 aa  751    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  57.06 
 
 
877 aa  986    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  49.11 
 
 
880 aa  825    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  41.22 
 
 
878 aa  650    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  57.18 
 
 
877 aa  988    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  57.18 
 
 
891 aa  988    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  57.06 
 
 
891 aa  987    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  57.06 
 
 
891 aa  986    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  56.95 
 
 
877 aa  985    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  57.4 
 
 
877 aa  988    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  56.9 
 
 
878 aa  993    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  100 
 
 
876 aa  1785    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.46 
 
 
872 aa  710    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  45.51 
 
 
883 aa  777    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  45.9 
 
 
870 aa  752    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  100 
 
 
876 aa  1785    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.49 
 
 
891 aa  652    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  45.75 
 
 
894 aa  752    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  57.18 
 
 
877 aa  988    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  55.81 
 
 
876 aa  953    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.79 
 
 
885 aa  701    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  57.13 
 
 
877 aa  991    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.66 
 
 
892 aa  654    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  46.78 
 
 
866 aa  746    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  46.69 
 
 
866 aa  745    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  43.81 
 
 
850 aa  657    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  43.91 
 
 
866 aa  732    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  48.05 
 
 
895 aa  822    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  50.11 
 
 
877 aa  837    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  48.72 
 
 
903 aa  822    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  51.36 
 
 
896 aa  878    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  49.72 
 
 
893 aa  821    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  50.61 
 
 
879 aa  840    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  56.67 
 
 
877 aa  983    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  51.06 
 
 
888 aa  875    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  45.46 
 
 
879 aa  744    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.62 
 
 
891 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.51 
 
 
892 aa  632  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.53 
 
 
906 aa  630  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.4 
 
 
892 aa  625  1e-178  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.22 
 
 
903 aa  619  1e-176  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.65 
 
 
892 aa  621  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.44 
 
 
868 aa  620  1e-176  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  39.78 
 
 
878 aa  619  1e-176  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.16 
 
 
908 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.57 
 
 
902 aa  618  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.53 
 
 
903 aa  612  9.999999999999999e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.44 
 
 
899 aa  613  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.53 
 
 
920 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  38.03 
 
 
910 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.53 
 
 
920 aa  614  9.999999999999999e-175  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.24 
 
 
903 aa  609  1e-173  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.84 
 
 
909 aa  612  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.38 
 
 
929 aa  610  1e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.75 
 
 
875 aa  610  1e-173  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  38.39 
 
 
945 aa  610  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.98 
 
 
899 aa  610  1e-173  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  37.69 
 
 
889 aa  610  1e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.49 
 
 
901 aa  602  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.01 
 
 
892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  37.87 
 
 
912 aa  603  1.0000000000000001e-171  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.49 
 
 
888 aa  602  1e-170  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.68 
 
 
929 aa  599  1e-170  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.86 
 
 
911 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  37.16 
 
 
908 aa  599  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  38.31 
 
 
905 aa  599  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.49 
 
 
893 aa  602  1e-170  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.36 
 
 
903 aa  597  1e-169  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.15 
 
 
924 aa  598  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.24 
 
 
893 aa  594  1e-168  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  37.72 
 
 
905 aa  593  1e-168  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.04 
 
 
930 aa  595  1e-168  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  38.08 
 
 
910 aa  593  1e-168  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.36 
 
 
902 aa  590  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.71 
 
 
939 aa  592  1e-167  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.34 
 
 
893 aa  590  1e-167  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.74 
 
 
926 aa  587  1e-166  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  38.1 
 
 
884 aa  588  1e-166  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  39.23 
 
 
939 aa  588  1e-166  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  36.71 
 
 
912 aa  588  1e-166  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  37.28 
 
 
928 aa  588  1e-166  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  37.69 
 
 
885 aa  587  1e-166  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.36 
 
 
896 aa  582  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  38.6 
 
 
901 aa  583  1.0000000000000001e-165  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.7 
 
 
916 aa  584  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.57 
 
 
893 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.22 
 
 
893 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  38.54 
 
 
895 aa  580  1e-164  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.75 
 
 
932 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.42 
 
 
933 aa  579  1e-164  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.75 
 
 
932 aa  580  1e-164  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.75 
 
 
932 aa  580  1e-164  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  39.25 
 
 
896 aa  576  1.0000000000000001e-163  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.23 
 
 
928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.18 
 
 
936 aa  575  1.0000000000000001e-163  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  38.53 
 
 
901 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>