More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tmel_1917 on replicon NC_009616
Organism: Thermosipho melanesiensis BI429



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  100 
 
 		 890 aa  1794    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  42.51 
 
 		 891 aa  709    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  39.74 
 
 		 915 aa  639    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  40.39 
 
 		 950 aa  636    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  57.11 
 
 		 898 aa  1053    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 903 aa  667    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  57 
 
 		 893 aa  1008    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 896 aa  675    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 896 aa  674    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 892 aa  684    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 941 aa  639    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.89 
 
 		 903 aa  650    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 924 aa  652    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 891 aa  676    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 915 aa  639    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 908 aa  637    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 892 aa  696    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 937 aa  636    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 937 aa  637    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 911 aa  637    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  39.63 
 
 		 915 aa  636    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 905 aa  650    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.98 
 
 		 892 aa  699    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.24 
 
 		 872 aa  646    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 899 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.61 
 
 		 926 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  56.77 
 
 		 893 aa  1003    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 899 aa  640    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 928 aa  651    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 888 aa  682    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 917 aa  646    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 902 aa  654    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 936 aa  649    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 913 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  42.7 
 
 		 892 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.2 
 
 		 892 aa  682    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  44.82 
 
 		 896 aa  736    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.75 
 
 		 893 aa  703    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 946 aa  663    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.95 
 
 		 902 aa  654    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 944 aa  640    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 943 aa  634  1e-180  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 926 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 926 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 923 aa  630  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 915 aa  632  1e-179  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 923 aa  631  1e-179  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 926 aa  632  1e-179  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 912 aa  631  1e-179  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 926 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 923 aa  632  1e-179  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 926 aa  630  1e-179  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 902 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.09 
 
 		 923 aa  632  1e-179  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 946 aa  628  1e-178  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 915 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  38.5 
 
 		 906 aa  626  1e-178  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 931 aa  627  1e-178  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  38 
 
 		 939 aa  627  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 916 aa  627  1e-178  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  40.9 
 
 		 883 aa  626  1e-178  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 904 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 908 aa  624  1e-177  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 922 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  39.24 
 
 		 933 aa  624  1e-177  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 934 aa  625  1e-177  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 929 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 934 aa  625  1e-177  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 934 aa  622  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 924 aa  625  1e-177  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 903 aa  622  1e-177  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 951 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.43 
 
 		 906 aa  619  1e-176  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 928 aa  619  1e-176  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 930 aa  621  1e-176  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 922 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.38 
 
 		 936 aa  620  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 929 aa  620  1e-176  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 931 aa  620  1e-176  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.76 
 
 		 911 aa  620  1e-176  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 922 aa  619  1e-176  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.2 
 
 		 903 aa  616  1e-175  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 932 aa  619  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 932 aa  617  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.23 
 
 		 928 aa  618  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.64 
 
 		 903 aa  618  1e-175  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 943 aa  619  1e-175  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 932 aa  617  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 918 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 907 aa  615  9.999999999999999e-175  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 878 aa  615  9.999999999999999e-175  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 921 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>