More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0360 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 891 aa  701    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 936 aa  656    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 924 aa  665    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.6 
 
 		 892 aa  668    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 896 aa  644    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 896 aa  644    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  57.11 
 
 		 890 aa  1046    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.74 
 
 		 903 aa  644    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 891 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 888 aa  637    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 892 aa  679    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 903 aa  642    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  53.4 
 
 		 893 aa  945    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  53.72 
 
 		 893 aa  957    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.55 
 
 		 892 aa  685    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.85 
 
 		 892 aa  693    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 899 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 899 aa  636    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  100 
 
 		 898 aa  1812    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.35 
 
 		 888 aa  673    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.49 
 
 		 892 aa  667    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.19 
 
 		 893 aa  708    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.88 
 
 		 946 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  45.95 
 
 		 896 aa  745    Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.13 
 
 		 926 aa  634  1e-180  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  40.5 
 
 		 922 aa  634  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 922 aa  631  1e-179  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 924 aa  630  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 944 aa  631  1e-179  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 922 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 922 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 934 aa  628  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.86 
 
 		 906 aa  628  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 923 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 923 aa  626  1e-178  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 923 aa  625  1e-178  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 928 aa  626  1e-178  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 926 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 926 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.9 
 
 		 941 aa  625  1e-177  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 902 aa  623  1e-177  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 926 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  38.41 
 
 		 926 aa  625  1e-177  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 902 aa  622  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 951 aa  624  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 912 aa  623  1e-177  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 950 aa  621  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 922 aa  621  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  41.78 
 
 		 872 aa  621  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 916 aa  618  1e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 935 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  39 
 
 		 932 aa  618  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 926 aa  617  1e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 934 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 943 aa  616  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 883 aa  619  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.9 
 
 		 902 aa  617  1e-175  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 921 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.87 
 
 		 915 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 939 aa  614  9.999999999999999e-175  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 921 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 904 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 934 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 921 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 930 aa  612  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  36.14 
 
 		 933 aa  609  1e-173  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 932 aa  609  1e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 921 aa  612  1e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 905 aa  610  1e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 976 aa  609  1e-173  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 918 aa  609  1e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 910 aa  611  1e-173  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 932 aa  609  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  40 
 
 		 930 aa  612  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  39.8 
 
 		 945 aa  609  1e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 932 aa  610  1e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40.07 
 
 		 870 aa  610  1e-173  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.55 
 
 		 911 aa  608  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  39.7 
 
 		 923 aa  609  1e-173  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  39.17 
 
 		 926 aa  608  9.999999999999999e-173  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  607  9.999999999999999e-173  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 939 aa  607  9.999999999999999e-173  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  40.26 
 
 		 918 aa  608  9.999999999999999e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 928 aa  608  9.999999999999999e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.27 
 
 		 878 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  36.52 
 
 		 968 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  36.77 
 
 		 924 aa  602  1.0000000000000001e-171  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 877 aa  602  1.0000000000000001e-171  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  38.72 
 
 		 933 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 894 aa  605  1.0000000000000001e-171  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  38.98 
 
 		 913 aa  602  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 917 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>