More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2156 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  45.11 
 
 
895 aa  786    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  48.54 
 
 
894 aa  824    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  42.22 
 
 
891 aa  695    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  44.58 
 
 
850 aa  719    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  43.24 
 
 
890 aa  656    Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  44.02 
 
 
876 aa  712    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  45.35 
 
 
877 aa  780    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  41.93 
 
 
880 aa  654    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  41.39 
 
 
873 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  45.35 
 
 
891 aa  780    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  45.24 
 
 
891 aa  779    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.15 
 
 
892 aa  690    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  45.35 
 
 
891 aa  781    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  39.91 
 
 
924 aa  671    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  36.64 
 
 
906 aa  647    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  43.46 
 
 
876 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  43.46 
 
 
876 aa  722    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  45.12 
 
 
877 aa  776    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.39 
 
 
891 aa  696    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  45.35 
 
 
877 aa  780    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  45.12 
 
 
877 aa  777    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.8 
 
 
903 aa  643    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.55 
 
 
892 aa  663    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  45.35 
 
 
877 aa  780    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.22 
 
 
892 aa  653    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  38.56 
 
 
908 aa  640    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  45.98 
 
 
877 aa  786    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  38.45 
 
 
904 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  40.43 
 
 
932 aa  655    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42.42 
 
 
885 aa  729    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  47.67 
 
 
870 aa  790    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  46.89 
 
 
883 aa  810    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  45.46 
 
 
877 aa  780    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  38.31 
 
 
920 aa  644    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  47.68 
 
 
878 aa  811    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  45.19 
 
 
876 aa  760    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.32 
 
 
893 aa  658    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.79 
 
 
888 aa  655    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  38.31 
 
 
920 aa  644    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  44.8 
 
 
879 aa  734    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  100 
 
 
872 aa  1756    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  48.98 
 
 
866 aa  803    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  49.21 
 
 
866 aa  806    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  46.02 
 
 
888 aa  764    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.79 
 
 
929 aa  639    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  42.43 
 
 
893 aa  657    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  38.8 
 
 
878 aa  649    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  43.58 
 
 
866 aa  749    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  42.5 
 
 
888 aa  696    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.98 
 
 
892 aa  646    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  46.12 
 
 
878 aa  745    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  43.03 
 
 
877 aa  694    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  41.01 
 
 
903 aa  644    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  43.62 
 
 
896 aa  721    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  41.69 
 
 
893 aa  656    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  42.95 
 
 
879 aa  678    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  48.04 
 
 
896 aa  796    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.09 
 
 
902 aa  652    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  45.12 
 
 
877 aa  776    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  42.4 
 
 
868 aa  687    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  43.48 
 
 
930 aa  666    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.13 
 
 
892 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  39.07 
 
 
903 aa  635  1e-180  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  41.78 
 
 
898 aa  634  1e-180  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.09 
 
 
903 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.28 
 
 
939 aa  634  1e-180  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.74 
 
 
909 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.11 
 
 
893 aa  634  1e-180  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.18 
 
 
912 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.46 
 
 
903 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.11 
 
 
893 aa  632  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  41.14 
 
 
902 aa  631  1e-179  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.41 
 
 
911 aa  631  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.22 
 
 
901 aa  625  1e-178  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  39.23 
 
 
903 aa  628  1e-178  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  36.07 
 
 
945 aa  627  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  41.03 
 
 
902 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.46 
 
 
926 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.5 
 
 
930 aa  627  1e-178  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.77 
 
 
875 aa  622  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  37.12 
 
 
902 aa  619  1e-176  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  38.16 
 
 
939 aa  616  1e-175  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  36.59 
 
 
933 aa  615  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  39.04 
 
 
885 aa  614  9.999999999999999e-175  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.01 
 
 
911 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.59 
 
 
950 aa  610  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  37.78 
 
 
901 aa  611  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  37.57 
 
 
911 aa  610  1e-173  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  36.48 
 
 
929 aa  609  1e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  43.1 
 
 
855 aa  611  1e-173  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.38 
 
 
929 aa  611  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  35.26 
 
 
910 aa  608  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  35.79 
 
 
899 aa  608  9.999999999999999e-173  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  37.81 
 
 
905 aa  606  9.999999999999999e-173  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  36.38 
 
 
901 aa  603  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.39 
 
 
899 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.03 
 
 
916 aa  602  1.0000000000000001e-171  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.4 
 
 
843 aa  602  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.39 
 
 
899 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  36.18 
 
 
899 aa  600  1e-170  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>