More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DET1391 on replicon NC_002936
Organism: Dehalococcoides ethenogenes 195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  100 
 
 
903 aa  1842    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.28 
 
 
932 aa  637    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.28 
 
 
932 aa  637    Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.55 
 
 
878 aa  645    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  40.07 
 
 
891 aa  636    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.28 
 
 
932 aa  638    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.34 
 
 
894 aa  660    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.58 
 
 
903 aa  642    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.16 
 
 
903 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.97 
 
 
891 aa  673    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  42.84 
 
 
936 aa  665    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.54 
 
 
893 aa  637    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  38.97 
 
 
902 aa  640    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  41.07 
 
 
883 aa  674    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  40.74 
 
 
965 aa  656    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  88.82 
 
 
903 aa  1652    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.81 
 
 
926 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  39.08 
 
 
910 aa  636    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  40.1 
 
 
972 aa  646    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.06 
 
 
928 aa  644    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  40.25 
 
 
850 aa  640    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.92 
 
 
951 aa  641    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.12 
 
 
912 aa  655    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.18 
 
 
870 aa  691    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  40.86 
 
 
866 aa  662    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  39.08 
 
 
902 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  40.91 
 
 
877 aa  650    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.45 
 
 
934 aa  646    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.48 
 
 
892 aa  651    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  41.06 
 
 
928 aa  659    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  43.23 
 
 
930 aa  732    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  96.9 
 
 
903 aa  1790    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.4 
 
 
893 aa  639    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.43 
 
 
891 aa  632  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  39.84 
 
 
877 aa  634  1e-180  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  40.07 
 
 
877 aa  635  1e-180  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  40.48 
 
 
908 aa  632  1e-180  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  39.96 
 
 
891 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  39.96 
 
 
891 aa  634  1e-180  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.01 
 
 
892 aa  633  1e-180  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  40.07 
 
 
877 aa  634  1e-180  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  39.96 
 
 
877 aa  634  1e-180  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.25 
 
 
930 aa  635  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  39.96 
 
 
877 aa  634  1e-180  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.87 
 
 
916 aa  632  1e-180  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  39.96 
 
 
877 aa  635  1e-180  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  40.8 
 
 
924 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.67 
 
 
913 aa  635  1e-180  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.77 
 
 
939 aa  629  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  38.56 
 
 
888 aa  632  1e-179  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  40.1 
 
 
953 aa  631  1e-179  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.56 
 
 
892 aa  629  1e-179  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.06 
 
 
928 aa  632  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.35 
 
 
917 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  39.01 
 
 
939 aa  630  1e-179  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  39.84 
 
 
877 aa  631  1e-179  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.63 
 
 
892 aa  629  1e-179  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  40.88 
 
 
915 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.74 
 
 
896 aa  627  1e-178  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.52 
 
 
928 aa  627  1e-178  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.1 
 
 
893 aa  627  1e-178  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  41.19 
 
 
876 aa  626  1e-178  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  39.81 
 
 
934 aa  625  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.88 
 
 
934 aa  626  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  39.37 
 
 
908 aa  624  1e-177  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.63 
 
 
928 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.74 
 
 
928 aa  625  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.85 
 
 
896 aa  624  1e-177  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.31 
 
 
928 aa  622  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  38.85 
 
 
907 aa  623  1e-177  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.63 
 
 
928 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.55 
 
 
929 aa  623  1e-177  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  40.04 
 
 
885 aa  624  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  39.01 
 
 
929 aa  624  1e-177  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.42 
 
 
931 aa  624  1e-177  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  40.52 
 
 
915 aa  623  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.51 
 
 
902 aa  623  1e-177  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.42 
 
 
928 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  38.89 
 
 
923 aa  624  1e-177  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.63 
 
 
928 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.31 
 
 
928 aa  620  1e-176  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  40.62 
 
 
915 aa  621  1e-176  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  38.71 
 
 
906 aa  620  1e-176  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  39.07 
 
 
872 aa  619  1e-176  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  39.46 
 
 
922 aa  619  1e-176  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  40.11 
 
 
931 aa  619  1e-176  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.52 
 
 
928 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  40.9 
 
 
915 aa  620  1e-176  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.96 
 
 
868 aa  617  1e-175  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  39.45 
 
 
904 aa  618  1e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  40.24 
 
 
878 aa  618  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  38.61 
 
 
866 aa  616  1e-175  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  40.57 
 
 
896 aa  617  1e-175  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  39.63 
 
 
946 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  38.41 
 
 
938 aa  615  9.999999999999999e-175  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>