More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0787 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  67.08 
 
 		 877 aa  1218    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  66.74 
 
 		 877 aa  1210    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  41.39 
 
 		 903 aa  640    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  44.46 
 
 		 891 aa  699    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  45.12 
 
 		 888 aa  740    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  55.24 
 
 		 876 aa  970    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  67.08 
 
 		 877 aa  1223    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  66.86 
 
 		 877 aa  1219    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 908 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 929 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  51.19 
 
 		 880 aa  868    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  41.45 
 
 		 901 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.94 
 
 		 888 aa  665    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 892 aa  639    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 891 aa  1217    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 891 aa  1218    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.66 
 
 		 850 aa  667    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 891 aa  1217    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  44.84 
 
 		 892 aa  699    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  48.27 
 
 		 883 aa  813    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  43.26 
 
 		 892 aa  665    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  55.81 
 
 		 876 aa  972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44 
 
 		 878 aa  700    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  43.96 
 
 		 891 aa  694    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  44 
 
 		 879 aa  724    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  48.31 
 
 		 870 aa  805    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  44.85 
 
 		 892 aa  689    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 896 aa  741    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  66.74 
 
 		 877 aa  1217    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 899 aa  640    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.93 
 
 		 903 aa  639    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  46.44 
 
 		 873 aa  725    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  47.19 
 
 		 885 aa  749    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  41.26 
 
 		 903 aa  639    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  100 
 
 		 876 aa  1790    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  45.71 
 
 		 868 aa  729    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  55.81 
 
 		 876 aa  972    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 920 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  45.3 
 
 		 866 aa  775    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  45.75 
 
 		 866 aa  773    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  45.19 
 
 		 872 aa  760    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  67.62 
 
 		 877 aa  1239    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  47.47 
 
 		 866 aa  789    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  53.45 
 
 		 895 aa  915    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 877 aa  1216    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  48.82 
 
 		 877 aa  845    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  47.26 
 
 		 903 aa  804    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  49.61 
 
 		 896 aa  882    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  49.89 
 
 		 893 aa  857    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  51.92 
 
 		 879 aa  884    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  53.78 
 
 		 888 aa  940    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  41.57 
 
 		 902 aa  654    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  79.27 
 
 		 878 aa  1449    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  46.37 
 
 		 894 aa  781    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 893 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  66.74 
 
 		 877 aa  1217    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 920 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  41.09 
 
 		 909 aa  646    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.31 
 
 		 892 aa  668    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  40.7 
 
 		 875 aa  635  1e-180  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  41.3 
 
 		 924 aa  634  1e-180  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  40.89 
 
 		 906 aa  634  1e-180  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  42.25 
 
 		 901 aa  630  1e-179  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.51 
 
 		 903 aa  629  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  39.71 
 
 		 885 aa  630  1e-179  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 893 aa  631  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  41.02 
 
 		 899 aa  629  1e-179  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.63 
 
 		 893 aa  625  1e-178  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 910 aa  626  1e-178  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  39.01 
 
 		 939 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  40.64 
 
 		 933 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.67 
 
 		 930 aa  620  1e-176  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  39.21 
 
 		 936 aa  619  1e-176  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 893 aa  622  1e-176  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 939 aa  621  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  42.67 
 
 		 910 aa  620  1e-176  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 898 aa  616  1e-175  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 903 aa  615  1e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 946 aa  617  1e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 889 aa  616  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  40.24 
 
 		 912 aa  615  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  39.29 
 
 		 932 aa  615  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 896 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 897 aa  612  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 902 aa  613  9.999999999999999e-175  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  41.47 
 
 		 917 aa  613  9.999999999999999e-175  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.19 
 
 		 896 aa  610  1e-173  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 911 aa  612  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 937 aa  611  1e-173  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 929 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  39.64 
 
 		 904 aa  606  9.999999999999999e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.72 
 
 		 936 aa  605  1.0000000000000001e-171  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 926 aa  604  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 955 aa  604  1.0000000000000001e-171  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  40.42 
 
 		 897 aa  601  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 905 aa  601  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 897 aa  599  1e-170  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  39.51 
 
 		 949 aa  600  1e-170  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  602  1e-170  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 905 aa  600  1e-170  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>