More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_2646 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  41.67 
 
 		 921 aa  645    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.47 
 
 		 892 aa  688    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  44.09 
 
 		 891 aa  672    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  79.22 
 
 		 899 aa  1363    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  43.92 
 
 		 915 aa  643    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  45.52 
 
 		 906 aa  664    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.74 
 
 		 892 aa  687    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 918 aa  642    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 922 aa  655    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 930 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  100 
 
 		 897 aa  1773    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  44.86 
 
 		 903 aa  687    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  99 
 
 		 897 aa  1753    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 907 aa  692    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.16 
 
 		 903 aa  652    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  43.57 
 
 		 937 aa  645    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  46.04 
 
 		 891 aa  723    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 928 aa  646    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 935 aa  644    Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 916 aa  640    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.54 
 
 		 892 aa  670    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 939 aa  647    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 921 aa  643    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.84 
 
 		 892 aa  678    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  96.1 
 
 		 897 aa  1665    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.61 
 
 		 926 aa  650    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  41.25 
 
 		 910 aa  652    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  41.81 
 
 		 921 aa  654    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  41.64 
 
 		 928 aa  640    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 922 aa  645    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 931 aa  638    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  41.91 
 
 		 935 aa  640    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  43.78 
 
 		 892 aa  694    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  44.18 
 
 		 908 aa  640    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 934 aa  649    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 922 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  41.3 
 
 		 922 aa  651    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 912 aa  637    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  41.65 
 
 		 918 aa  660    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  44.03 
 
 		 888 aa  684    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  41.56 
 
 		 921 aa  644    Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  43.67 
 
 		 937 aa  645    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  41.27 
 
 		 928 aa  653    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  41.62 
 
 		 922 aa  657    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  42.27 
 
 		 908 aa  662    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.1 
 
 		 893 aa  647    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  44.09 
 
 		 937 aa  648    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  41.76 
 
 		 923 aa  646    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  42.09 
 
 		 940 aa  638    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 911 aa  634  1e-180  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 930 aa  633  1e-180  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  40.71 
 
 		 933 aa  634  1e-180  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  40 
 
 		 905 aa  632  1e-180  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  40.57 
 
 		 930 aa  632  1e-180  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 911 aa  635  1e-180  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  40.35 
 
 		 945 aa  634  1e-180  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 915 aa  631  1e-179  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  42.76 
 
 		 915 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  42.16 
 
 		 925 aa  629  1e-179  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  42.15 
 
 		 943 aa  630  1e-179  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.92 
 
 		 895 aa  629  1e-179  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  42.76 
 
 		 915 aa  630  1e-179  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  42.6 
 
 		 902 aa  631  1e-179  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 932 aa  629  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  41.7 
 
 		 902 aa  627  1e-178  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 932 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  42.73 
 
 		 915 aa  628  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  38.96 
 
 		 928 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  42.83 
 
 		 917 aa  627  1e-178  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  42.93 
 
 		 913 aa  628  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 932 aa  629  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  43.34 
 
 		 931 aa  624  1e-177  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  41.35 
 
 		 926 aa  623  1e-177  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 934 aa  624  1e-177  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  41.59 
 
 		 902 aa  624  1e-177  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  41.26 
 
 		 915 aa  623  1e-177  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  40.4 
 
 		 937 aa  620  1e-176  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 926 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 921 aa  619  1e-176  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 926 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 934 aa  620  1e-176  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 923 aa  622  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 926 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 923 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  41.76 
 
 		 926 aa  620  1e-176  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 924 aa  619  1e-176  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 913 aa  622  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  41.89 
 
 		 923 aa  621  1e-176  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  42.25 
 
 		 917 aa  621  1e-176  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  42.04 
 
 		 917 aa  619  1e-176  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  41.93 
 
 		 917 aa  616  1e-175  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 951 aa  616  1e-175  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 883 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 934 aa  617  1e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 929 aa  616  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 937 aa  613  9.999999999999999e-175  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  43.72 
 
 		 904 aa  615  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  42.66 
 
 		 924 aa  615  9.999999999999999e-175  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  41.54 
 
 		 979 aa  614  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  40.41 
 
 		 913 aa  612  9.999999999999999e-175  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>