More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2345 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  41.62 
 
 
901 aa  636    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  46.54 
 
 
873 aa  737    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  100 
 
 
895 aa  1837    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.01 
 
 
891 aa  657    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.97 
 
 
850 aa  703    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  51.51 
 
 
877 aa  911    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  47.27 
 
 
876 aa  809    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.89 
 
 
879 aa  717    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  51.51 
 
 
877 aa  909    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  46.33 
 
 
868 aa  720    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  45.58 
 
 
880 aa  742    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.44 
 
 
892 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  45.02 
 
 
872 aa  781    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  51.51 
 
 
891 aa  912    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  51.51 
 
 
891 aa  912    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  51.62 
 
 
891 aa  914    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  52.35 
 
 
877 aa  915    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  47.4 
 
 
878 aa  736    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  40.18 
 
 
893 aa  659    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  51.73 
 
 
877 aa  915    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.33 
 
 
891 aa  650    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  42.89 
 
 
894 aa  746    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  44.52 
 
 
930 aa  691    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  43.3 
 
 
899 aa  643    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  44.15 
 
 
893 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  51.51 
 
 
877 aa  911    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  53.41 
 
 
878 aa  942    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  51.45 
 
 
877 aa  907    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  44.62 
 
 
888 aa  754    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  48.22 
 
 
876 aa  826    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  47.57 
 
 
885 aa  772    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.96 
 
 
893 aa  657    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  51.51 
 
 
877 aa  912    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  51.96 
 
 
877 aa  914    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.33 
 
 
892 aa  643    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  47.88 
 
 
883 aa  813    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  44.03 
 
 
870 aa  726    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  40.76 
 
 
946 aa  639    Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  43.48 
 
 
866 aa  737    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  43.03 
 
 
866 aa  733    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  43.14 
 
 
896 aa  725    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  48.22 
 
 
876 aa  826    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.93 
 
 
892 aa  659    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  46.28 
 
 
866 aa  758    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  42.98 
 
 
888 aa  647    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  44.1 
 
 
877 aa  716    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  43.11 
 
 
903 aa  707    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  43.66 
 
 
896 aa  746    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  43.75 
 
 
893 aa  709    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  45.84 
 
 
879 aa  736    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  52.63 
 
 
876 aa  902    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  41.63 
 
 
892 aa  642    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.87 
 
 
902 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  42.2 
 
 
899 aa  633  1e-180  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  40.55 
 
 
885 aa  635  1e-180  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  39.85 
 
 
903 aa  633  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.54 
 
 
939 aa  630  1e-179  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.09 
 
 
892 aa  631  1e-179  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.53 
 
 
903 aa  627  1e-178  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  40.74 
 
 
893 aa  627  1e-178  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  40.75 
 
 
903 aa  623  1e-177  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  41.46 
 
 
906 aa  624  1e-177  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  40.4 
 
 
875 aa  624  1e-177  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  41.46 
 
 
910 aa  623  1e-177  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.27 
 
 
926 aa  620  1e-176  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  41.32 
 
 
910 aa  621  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  40.02 
 
 
936 aa  617  1e-175  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.72 
 
 
934 aa  615  1e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  41.27 
 
 
897 aa  618  1e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  41.78 
 
 
924 aa  619  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.69 
 
 
916 aa  613  9.999999999999999e-175  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  41.27 
 
 
897 aa  615  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  40.81 
 
 
899 aa  613  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  42.48 
 
 
888 aa  614  9.999999999999999e-175  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  39.74 
 
 
911 aa  613  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  39.76 
 
 
932 aa  609  1e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  40.94 
 
 
897 aa  609  1e-173  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.37 
 
 
930 aa  611  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.97 
 
 
911 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  40.93 
 
 
884 aa  607  9.999999999999999e-173  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  40.42 
 
 
889 aa  607  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.66 
 
 
903 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  39.87 
 
 
908 aa  605  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  40.64 
 
 
903 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.5 
 
 
928 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40.02 
 
 
904 aa  599  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  38.55 
 
 
896 aa  599  1e-170  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  40.99 
 
 
908 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  39.98 
 
 
909 aa  601  1e-170  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  38.53 
 
 
936 aa  601  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  39.38 
 
 
929 aa  600  1e-170  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.96 
 
 
930 aa  601  1e-170  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.87 
 
 
912 aa  600  1e-170  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  40.6 
 
 
926 aa  598  1e-169  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  40.58 
 
 
855 aa  596  1e-169  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  42.6 
 
 
901 aa  597  1e-169  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  39.96 
 
 
912 aa  596  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  38.76 
 
 
935 aa  596  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.7 
 
 
951 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  36.11 
 
 
898 aa  594  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>