More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_0713 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 894 aa  687    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  47.5 
 
 		 876 aa  794    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  48.82 
 
 		 877 aa  832    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 883 aa  639    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  50.11 
 
 		 880 aa  841    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  48.71 
 
 		 877 aa  830    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  41.46 
 
 		 896 aa  656    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  48.6 
 
 		 891 aa  830    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  48.71 
 
 		 891 aa  832    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  48.71 
 
 		 891 aa  831    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  48.6 
 
 		 877 aa  830    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  49.72 
 
 		 876 aa  821    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  48.6 
 
 		 877 aa  828    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  48.6 
 
 		 877 aa  832    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  48.71 
 
 		 877 aa  829    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  48.6 
 
 		 877 aa  830    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 872 aa  645    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  48.71 
 
 		 877 aa  828    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  49.72 
 
 		 876 aa  821    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  57.53 
 
 		 888 aa  1029    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 870 aa  666    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  49.89 
 
 		 876 aa  838    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  50.95 
 
 		 878 aa  872    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 866 aa  643    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  50.45 
 
 		 877 aa  851    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  59.6 
 
 		 903 aa  1102    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  52.85 
 
 		 896 aa  924    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  100 
 
 		 893 aa  1830    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  51.88 
 
 		 879 aa  867    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  43.75 
 
 		 895 aa  704    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  41.29 
 
 		 866 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  40.96 
 
 		 866 aa  626  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 885 aa  625  1e-177  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 879 aa  623  1e-177  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  39.49 
 
 		 888 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 891 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  41.14 
 
 		 850 aa  595  1e-168  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 878 aa  592  1e-167  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  38.05 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  39.25 
 
 		 873 aa  580  1e-164  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  39.32 
 
 		 926 aa  580  1e-164  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 892 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  39.08 
 
 		 896 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 902 aa  563  1.0000000000000001e-159  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 956 aa  561  1e-158  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 903 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 912 aa  562  1e-158  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.72 
 
 		 893 aa  556  1e-157  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 896 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 932 aa  556  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 893 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.77 
 
 		 930 aa  555  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.68 
 
 		 892 aa  553  1e-156  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 949 aa  553  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.21 
 
 		 898 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 924 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 911 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 892 aa  550  1e-155  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.02 
 
 		 928 aa  550  1e-155  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 929 aa  550  1e-155  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 911 aa  551  1e-155  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 875 aa  546  1e-154  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 916 aa  547  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 929 aa  546  1e-154  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 903 aa  548  1e-154  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 934 aa  549  1e-154  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 885 aa  544  1e-153  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  35.73 
 
 		 903 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 891 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 950 aa  542  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 946 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 943 aa  538  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.23 
 
 		 903 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  35.44 
 
 		 939 aa  536  1e-151  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 920 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  36.99 
 
 		 920 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 915 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 906 aa  534  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 940 aa  534  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.62 
 
 		 928 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  37.79 
 
 		 915 aa  534  1e-150  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 928 aa  534  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.31 
 
 		 892 aa  535  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 908 aa  534  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 928 aa  535  1e-150  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 929 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 892 aa  533  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 915 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>