More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccur_08230 on replicon NC_013170
Organism: Cryptobacterium curtum DSM 15641



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  42.84 
 
 		 878 aa  643    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  100 
 
 		 885 aa  1814    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  42 
 
 		 885 aa  661    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  58.42 
 
 		 878 aa  1040    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  51.4 
 
 		 912 aa  833    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 883 aa  649    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  62.49 
 
 		 875 aa  1093    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 878 aa  647    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 895 aa  632  1e-180  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 888 aa  635  1e-180  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 866 aa  633  1e-180  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 850 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 868 aa  629  1e-179  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 866 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 876 aa  623  1e-177  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 870 aa  620  1e-176  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.11 
 
 		 904 aa  612  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  40.19 
 
 		 912 aa  615  9.999999999999999e-175  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 893 aa  610  1e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.21 
 
 		 893 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  39.04 
 
 		 872 aa  605  9.999999999999999e-173  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 891 aa  597  1e-169  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 891 aa  596  1e-169  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 891 aa  596  1e-169  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 877 aa  598  1e-169  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 877 aa  596  1e-169  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 877 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 877 aa  598  1e-169  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 906 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 877 aa  594  1e-168  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 896 aa  595  1e-168  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  37.17 
 
 		 877 aa  593  1e-168  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39.11 
 
 		 928 aa  590  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 903 aa  588  1e-166  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 876 aa  587  1e-166  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 877 aa  588  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.26 
 
 		 928 aa  579  1e-164  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  36.31 
 
 		 879 aa  581  1e-164  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 931 aa  579  1e-164  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 928 aa  578  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 891 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 940 aa  576  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.15 
 
 		 928 aa  577  1.0000000000000001e-163  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.01 
 
 		 903 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 934 aa  575  1.0000000000000001e-162  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 916 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  38.85 
 
 		 929 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 929 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 892 aa  571  1e-161  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 876 aa  572  1e-161  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 928 aa  570  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 903 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 906 aa  572  1e-161  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 932 aa  567  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 932 aa  566  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 932 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 928 aa  568  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 893 aa  566  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 915 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 884 aa  564  1.0000000000000001e-159  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 888 aa  563  1.0000000000000001e-159  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 956 aa  562  1.0000000000000001e-159  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 915 aa  559  1e-158  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 936 aa  560  1e-158  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 902 aa  561  1e-158  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 930 aa  561  1e-158  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 935 aa  560  1e-158  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.57 
 
 		 930 aa  560  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 915 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 877 aa  562  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 879 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 901 aa  561  1e-158  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 891 aa  557  1e-157  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 924 aa  557  1e-157  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 915 aa  556  1e-157  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 902 aa  558  1e-157  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 896 aa  553  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 899 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 899 aa  552  1e-156  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 934 aa  554  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 951 aa  555  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 930 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 934 aa  551  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 888 aa  551  1e-155  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  38.45 
 
 		 917 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 913 aa  547  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 920 aa  546  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>