More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BCAH187_A4712 on replicon NC_011658
Organism: Bacillus cereus AH187



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  45.72 
 
 
873 aa  738    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.89 
 
 
891 aa  685    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  56.49 
 
 
876 aa  973    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  98.52 
 
 
877 aa  1776    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  99.54 
 
 
877 aa  1792    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  44.56 
 
 
883 aa  783    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  38.88 
 
 
939 aa  636    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  51.24 
 
 
880 aa  862    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  99.43 
 
 
891 aa  1792    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  99.54 
 
 
891 aa  1793    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  99.43 
 
 
891 aa  1790    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  48.03 
 
 
870 aa  818    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  99.54 
 
 
877 aa  1793    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  42.6 
 
 
878 aa  704    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  56.95 
 
 
876 aa  985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  66.63 
 
 
876 aa  1193    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.4 
 
 
892 aa  662    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  42.17 
 
 
891 aa  707    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  100 
 
 
877 aa  1801    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  43.2 
 
 
850 aa  693    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.33 
 
 
892 aa  662    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  98.29 
 
 
877 aa  1778    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  99.54 
 
 
877 aa  1793    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  45.75 
 
 
896 aa  762    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.48 
 
 
892 aa  711    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  56.95 
 
 
876 aa  985    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  44.28 
 
 
885 aa  736    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  51.73 
 
 
895 aa  908    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  53.15 
 
 
888 aa  930    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  44.91 
 
 
894 aa  769    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  42.76 
 
 
868 aa  692    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.13 
 
 
892 aa  656    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43.42 
 
 
888 aa  734    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  68.34 
 
 
878 aa  1274    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  96.58 
 
 
877 aa  1743    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  46.05 
 
 
866 aa  772    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  45.96 
 
 
866 aa  768    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  40.33 
 
 
888 aa  640    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  45.12 
 
 
872 aa  762    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  45.15 
 
 
879 aa  752    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  44.29 
 
 
866 aa  754    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.31 
 
 
903 aa  642    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  49.27 
 
 
877 aa  843    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  47.82 
 
 
903 aa  835    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  48.65 
 
 
896 aa  867    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  48.71 
 
 
893 aa  829    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  50.85 
 
 
879 aa  869    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.91 
 
 
902 aa  640    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  90.65 
 
 
877 aa  1659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  41.09 
 
 
893 aa  652    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.54 
 
 
892 aa  648    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  39.51 
 
 
903 aa  633  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  39.84 
 
 
903 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  39.13 
 
 
930 aa  629  1e-179  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  38.95 
 
 
875 aa  626  1e-178  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.06 
 
 
901 aa  624  1e-177  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  39.24 
 
 
924 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.38 
 
 
906 aa  621  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  39.31 
 
 
929 aa  621  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  38.77 
 
 
909 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  39.48 
 
 
920 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.81 
 
 
939 aa  620  1e-176  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  39.48 
 
 
920 aa  620  1e-176  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  39.33 
 
 
908 aa  615  1e-175  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  39.16 
 
 
899 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  38.83 
 
 
899 aa  615  9.999999999999999e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  36.71 
 
 
911 aa  615  9.999999999999999e-175  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  39.05 
 
 
946 aa  612  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  39.37 
 
 
910 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.13 
 
 
893 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  38.22 
 
 
936 aa  605  9.999999999999999e-173  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  39.73 
 
 
893 aa  605  1.0000000000000001e-171  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  39.15 
 
 
893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  39.2 
 
 
910 aa  604  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  38.51 
 
 
889 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  38.06 
 
 
904 aa  600  1e-170  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.7 
 
 
956 aa  600  1e-170  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.57 
 
 
951 aa  599  1e-170  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.94 
 
 
933 aa  600  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.73 
 
 
911 aa  597  1e-169  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  37.47 
 
 
949 aa  598  1e-169  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.85 
 
 
916 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  37.17 
 
 
885 aa  598  1e-169  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  39.17 
 
 
926 aa  593  1e-168  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  38.9 
 
 
929 aa  593  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  37.72 
 
 
950 aa  594  1e-168  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.67 
 
 
912 aa  595  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  38.22 
 
 
898 aa  595  1e-168  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.82 
 
 
934 aa  592  1e-168  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.34 
 
 
911 aa  593  1e-168  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  39.35 
 
 
936 aa  595  1e-168  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  37.96 
 
 
949 aa  592  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.8 
 
 
903 aa  591  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  37.54 
 
 
955 aa  590  1e-167  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.61 
 
 
895 aa  587  1e-166  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  38.03 
 
 
893 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  38.23 
 
 
890 aa  586  1e-166  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  37.53 
 
 
894 aa  585  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.23 
 
 
896 aa  583  1.0000000000000001e-165  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  37.98 
 
 
899 aa  585  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>