More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1330 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  100 
 
 		 879 aa  1752    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  43.06 
 
 		 894 aa  722    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  45.82 
 
 		 876 aa  740    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 877 aa  750    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.73 
 
 		 870 aa  679    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.91 
 
 		 880 aa  679    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  44.81 
 
 		 877 aa  749    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 891 aa  749    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 891 aa  749    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  44.92 
 
 		 891 aa  749    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 877 aa  751    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  42.57 
 
 		 888 aa  694    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  43.09 
 
 		 883 aa  723    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  45.03 
 
 		 877 aa  751    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  45.46 
 
 		 876 aa  744    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  38.68 
 
 		 885 aa  660    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  44.7 
 
 		 877 aa  749    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  45.46 
 
 		 876 aa  744    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  42.17 
 
 		 896 aa  664    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 877 aa  750    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  40.88 
 
 		 850 aa  647    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  45.15 
 
 		 877 aa  752    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  46.39 
 
 		 866 aa  742    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  46.28 
 
 		 866 aa  737    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.78 
 
 		 895 aa  714    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 866 aa  709    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  44.82 
 
 		 878 aa  751    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  44.8 
 
 		 872 aa  719    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 877 aa  660    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  40.73 
 
 		 903 aa  635    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  45.79 
 
 		 896 aa  739    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  43.87 
 
 		 879 aa  702    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  44.7 
 
 		 877 aa  747    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 888 aa  645    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  44 
 
 		 876 aa  708    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  39.6 
 
 		 873 aa  625  1e-177  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 893 aa  623  1e-177  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.37 
 
 		 878 aa  617  1e-175  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  36.46 
 
 		 891 aa  601  1e-170  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 903 aa  598  1e-170  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.35 
 
 		 892 aa  596  1e-169  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 892 aa  597  1e-169  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 896 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 896 aa  590  1e-167  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 912 aa  590  1e-167  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 924 aa  588  1e-166  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 888 aa  587  1e-166  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 892 aa  589  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.2 
 
 		 893 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 892 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.31 
 
 		 885 aa  581  1e-164  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 893 aa  580  1e-164  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 911 aa  580  1e-164  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 929 aa  582  1e-164  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 868 aa  580  1e-164  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 906 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 911 aa  578  1.0000000000000001e-163  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 892 aa  572  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 939 aa  573  1.0000000000000001e-162  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  35.35 
 
 		 903 aa  572  1e-161  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.31 
 
 		 926 aa  569  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.68 
 
 		 929 aa  572  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.11 
 
 		 903 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 928 aa  569  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 903 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 951 aa  568  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 893 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.16 
 
 		 928 aa  567  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  35.52 
 
 		 903 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 936 aa  564  1.0000000000000001e-159  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 908 aa  565  1.0000000000000001e-159  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 939 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.44 
 
 		 932 aa  561  1e-158  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 932 aa  559  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 932 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 932 aa  559  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  35.77 
 
 		 926 aa  556  1e-157  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 930 aa  558  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 906 aa  557  1e-157  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 936 aa  553  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 934 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 893 aa  554  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 843 aa  555  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 912 aa  555  1e-156  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  35.91 
 
 		 893 aa  550  1e-155  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 916 aa  551  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 901 aa  550  1e-155  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  34.38 
 
 		 884 aa  552  1e-155  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 949 aa  549  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 901 aa  550  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 904 aa  549  1e-154  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  35.65 
 
 		 979 aa  547  1e-154  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 935 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 897 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 897 aa  547  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 911 aa  546  1e-154  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.27 
 
 		 935 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  34.26 
 
 		 945 aa  544  1e-153  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 897 aa  545  1e-153  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>