More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2043 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  60.99 
 
 		 902 aa  1053    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 870 aa  654    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  49.24 
 
 		 937 aa  784    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  61.53 
 
 		 904 aa  1057    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  59.69 
 
 		 908 aa  1065    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  60.68 
 
 		 909 aa  1092    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  59.15 
 
 		 910 aa  1004    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  67.07 
 
 		 912 aa  1203    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  62.43 
 
 		 893 aa  1100    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  60.76 
 
 		 888 aa  1015    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  58.06 
 
 		 929 aa  979    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  59.61 
 
 		 933 aa  1070    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  61.23 
 
 		 901 aa  1089    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  56.97 
 
 		 908 aa  924    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  86.26 
 
 		 945 aa  1504    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  59.44 
 
 		 929 aa  1063    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  60.02 
 
 		 920 aa  1073    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  59.78 
 
 		 905 aa  1030    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  62.53 
 
 		 901 aa  1046    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  59.91 
 
 		 949 aa  1065    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  59.21 
 
 		 917 aa  1028    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  60.02 
 
 		 920 aa  1073    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  41.34 
 
 		 955 aa  649    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  50.61 
 
 		 894 aa  839    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  59.34 
 
 		 928 aa  1027    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  57.68 
 
 		 908 aa  956    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  67.53 
 
 		 906 aa  1207    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  58.47 
 
 		 901 aa  982    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  56.13 
 
 		 904 aa  897    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14980  DNA polymerase I  48.02 
 
 		 904 aa  749    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0168327  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  49.56 
 
 		 955 aa  845    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  56.78 
 
 		 905 aa  900    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  100 
 
 		 911 aa  1826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  67.33 
 
 		 910 aa  1159    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  61.8 
 
 		 899 aa  1070    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  62.58 
 
 		 899 aa  1080    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  61.26 
 
 		 889 aa  1095    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  53.07 
 
 		 893 aa  905    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  39.47 
 
 		 878 aa  631  1e-179  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  36.77 
 
 		 872 aa  623  1e-177  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 883 aa  619  1e-176  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  40.66 
 
 		 891 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  40.49 
 
 		 895 aa  611  1e-173  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 903 aa  606  9.999999999999999e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  41.22 
 
 		 892 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  37.71 
 
 		 888 aa  608  9.999999999999999e-173  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 877 aa  605  9.999999999999999e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 866 aa  608  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 866 aa  607  9.999999999999999e-173  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.84 
 
 		 892 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 877 aa  605  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  40.67 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  38 
 
 		 877 aa  604  1.0000000000000001e-171  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 891 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.97 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.97 
 
 		 876 aa  603  1.0000000000000001e-171  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 877 aa  603  1.0000000000000001e-171  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 877 aa  601  1e-170  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 877 aa  601  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  41.23 
 
 		 906 aa  598  1e-169  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  42.26 
 
 		 899 aa  598  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.33 
 
 		 891 aa  595  1e-168  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 894 aa  594  1e-168  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.8 
 
 		 903 aa  590  1e-167  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.44 
 
 		 877 aa  590  1e-167  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 868 aa  587  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 892 aa  587  1e-166  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  42.75 
 
 		 897 aa  588  1e-166  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 892 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  42.42 
 
 		 897 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 876 aa  580  1e-164  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  41 
 
 		 904 aa  582  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 888 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  42.31 
 
 		 897 aa  576  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 902 aa  576  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 939 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  39.81 
 
 		 940 aa  573  1.0000000000000001e-162  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 902 aa  575  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.75 
 
 		 878 aa  573  1.0000000000000001e-162  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 866 aa  573  1.0000000000000001e-162  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 873 aa  571  1e-161  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 965 aa  566  1e-160  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 896 aa  563  1.0000000000000001e-159  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  40.29 
 
 		 885 aa  563  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 931 aa  564  1.0000000000000001e-159  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  39.09 
 
 		 905 aa  561  1e-158  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.94 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 893 aa  557  1e-157  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 930 aa  553  1e-156  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.23 
 
 		 850 aa  555  1e-156  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  34.75 
 
 		 879 aa  553  1e-156  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 924 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 934 aa  553  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 896 aa  551  1e-155  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 911 aa  551  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  39.18 
 
 		 910 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 893 aa  552  1e-155  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>