More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2445 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  49.04 
 
 		 876 aa  823    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  49.77 
 
 		 878 aa  864    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  49.27 
 
 		 877 aa  844    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  67.27 
 
 		 880 aa  1206    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 894 aa  667    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  40.65 
 
 		 879 aa  660    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 891 aa  843    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 891 aa  843    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 891 aa  843    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.03 
 
 		 872 aa  681    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  49.27 
 
 		 877 aa  840    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 877 aa  846    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  50.11 
 
 		 876 aa  837    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  50.51 
 
 		 877 aa  858    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 877 aa  843    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  43.63 
 
 		 888 aa  680    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  50.11 
 
 		 876 aa  837    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 885 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  48.82 
 
 		 876 aa  831    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  51.52 
 
 		 888 aa  908    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 883 aa  664    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 866 aa  657    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  42.67 
 
 		 866 aa  660    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 870 aa  650    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 866 aa  659    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  44.1 
 
 		 895 aa  716    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  49.27 
 
 		 877 aa  843    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  100 
 
 		 877 aa  1782    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  47.36 
 
 		 903 aa  830    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  53.54 
 
 		 896 aa  960    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  50.45 
 
 		 893 aa  851    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  68.32 
 
 		 879 aa  1224    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 877 aa  846    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  49.15 
 
 		 877 aa  843    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  42.12 
 
 		 873 aa  631  1e-179  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  41.41 
 
 		 850 aa  628  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  39.63 
 
 		 896 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.71 
 
 		 891 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 892 aa  599  1e-170  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.62 
 
 		 878 aa  596  1e-169  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 868 aa  588  1e-166  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  39.63 
 
 		 892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  38.58 
 
 		 901 aa  579  1e-164  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  39.43 
 
 		 892 aa  581  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 891 aa  576  1.0000000000000001e-163  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 956 aa  577  1.0000000000000001e-163  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.78 
 
 		 906 aa  575  1.0000000000000001e-162  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 924 aa  571  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 911 aa  571  1e-161  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 892 aa  564  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 892 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 895 aa  561  1e-158  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 885 aa  562  1e-158  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 926 aa  560  1e-158  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 903 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 932 aa  557  1e-157  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 933 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.29 
 
 		 928 aa  557  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 893 aa  554  1e-156  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.32 
 
 		 934 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 893 aa  555  1e-156  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.4 
 
 		 912 aa  553  1e-156  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 901 aa  551  1e-155  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 912 aa  546  1e-154  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  36.69 
 
 		 936 aa  549  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 899 aa  546  1e-154  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.93 
 
 		 928 aa  546  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 910 aa  547  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 888 aa  546  1e-154  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.12 
 
 		 903 aa  545  1e-153  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 909 aa  544  1e-153  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  39.02 
 
 		 917 aa  540  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 911 aa  540  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  541  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 951 aa  540  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 902 aa  541  9.999999999999999e-153  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 889 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  38.52 
 
 		 912 aa  541  9.999999999999999e-153  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 899 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 930 aa  537  1e-151  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 945 aa  538  1e-151  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 915 aa  537  1e-151  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 932 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  38.17 
 
 		 904 aa  537  1e-151  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 920 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  36.94 
 
 		 932 aa  536  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 932 aa  536  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 893 aa  539  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 920 aa  536  1e-151  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 905 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.85 
 
 		 934 aa  534  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 929 aa  533  1e-150  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 910 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 911 aa  535  1e-150  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.53 
 
 		 936 aa  533  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  35.72 
 
 		 929 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  35.75 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  37.01 
 
 		 938 aa  534  1e-150  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 929 aa  532  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>