More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfl582 on replicon NC_006055
Organism: Mesoplasma florum L1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  100 
 
 		 895 aa  1801    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  49.51 
 
 		 911 aa  866    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 878 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 877 aa  590  1e-167  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  586  1e-166  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 891 aa  586  1e-166  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 891 aa  587  1e-166  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.42 
 
 		 877 aa  586  1e-166  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  585  1e-166  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 877 aa  587  1e-166  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  585  1e-166  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 877 aa  587  1e-166  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 877 aa  585  1.0000000000000001e-165  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 876 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 876 aa  580  1e-164  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 877 aa  582  1e-164  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 876 aa  560  1e-158  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 877 aa  561  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  37.35 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 876 aa  557  1e-157  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 895 aa  556  1e-157  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 879 aa  559  1e-157  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 888 aa  543  1e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 880 aa  542  9.999999999999999e-153  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  35.01 
 
 		 878 aa  536  1e-151  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 872 aa  528  1e-148  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 883 aa  529  1e-148  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  36.23 
 
 		 896 aa  526  1e-148  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 888 aa  529  1e-148  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  36.89 
 
 		 903 aa  528  1e-148  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 893 aa  520  1e-146  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 894 aa  514  1e-144  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 866 aa  512  1e-143  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  37.19 
 
 		 866 aa  511  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 930 aa  490  1e-137  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 943 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  34.03 
 
 		 868 aa  483  1e-135  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 873 aa  484  1e-135  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 870 aa  485  1e-135  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  33.48 
 
 		 885 aa  481  1e-134  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 866 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  32.66 
 
 		 903 aa  473  1e-132  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  33.26 
 
 		 936 aa  475  1e-132  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  31.72 
 
 		 926 aa  472  1.0000000000000001e-131  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 892 aa  470  1.0000000000000001e-131  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 879 aa  470  1.0000000000000001e-131  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 891 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  32.02 
 
 		 903 aa  468  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  32.97 
 
 		 885 aa  467  9.999999999999999e-131  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  31.52 
 
 		 901 aa  469  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 892 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  31.62 
 
 		 903 aa  464  1e-129  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  32.91 
 
 		 875 aa  465  1e-129  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.19 
 
 		 891 aa  462  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.85 
 
 		 850 aa  462  9.999999999999999e-129  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  32.69 
 
 		 950 aa  459  1e-127  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  33.51 
 
 		 916 aa  455  1.0000000000000001e-126  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  32.44 
 
 		 946 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 899 aa  456  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  31.22 
 
 		 920 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  31.22 
 
 		 920 aa  450  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  32.54 
 
 		 892 aa  447  1.0000000000000001e-124  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 892 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  33.54 
 
 		 944 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  30.81 
 
 		 929 aa  446  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 896 aa  447  1.0000000000000001e-124  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  33.09 
 
 		 946 aa  447  1.0000000000000001e-124  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  31.11 
 
 		 924 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 892 aa  443  1e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 893 aa  443  1e-123  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  31.02 
 
 		 909 aa  439  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 893 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  31.78 
 
 		 905 aa  440  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  31.33 
 
 		 908 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  31.79 
 
 		 926 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 908 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  33.05 
 
 		 893 aa  442  9.999999999999999e-123  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  32.21 
 
 		 888 aa  438  1e-121  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  34.79 
 
 		 855 aa  436  1e-121  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  32.47 
 
 		 966 aa  438  1e-121  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  31.29 
 
 		 924 aa  436  1e-121  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  32.87 
 
 		 930 aa  436  1e-121  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  30.89 
 
 		 889 aa  438  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  31.32 
 
 		 936 aa  434  1e-120  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  31.2 
 
 		 893 aa  432  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  30.46 
 
 		 902 aa  430  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 953 aa  431  1e-119  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  30.41 
 
 		 910 aa  431  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  31.12 
 
 		 904 aa  427  1e-118  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  31.73 
 
 		 906 aa  429  1e-118  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 917 aa  426  1e-118  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  29.68 
 
 		 906 aa  429  1e-118  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  31.14 
 
 		 893 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  31.64 
 
 		 902 aa  428  1e-118  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  29.46 
 
 		 908 aa  425  1e-117  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  29.92 
 
 		 908 aa  423  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.59 
 
 		 898 aa  424  1e-117  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  29.54 
 
 		 904 aa  424  1e-117  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  32.08 
 
 		 926 aa  423  1e-117  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  29.6 
 
 		 933 aa  424  1e-117  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>