More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_1892 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  44.34 
 
 
895 aa  715    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  42.58 
 
 
877 aa  699    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  43.63 
 
 
896 aa  699    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  43.23 
 
 
885 aa  691    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.31 
 
 
872 aa  679    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  100 
 
 
930 aa  1908    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  42.69 
 
 
877 aa  708    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  42.61 
 
 
896 aa  654    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  43.15 
 
 
877 aa  717    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.73 
 
 
891 aa  610  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  37.63 
 
 
893 aa  607  9.999999999999999e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.23 
 
 
892 aa  588  1e-166  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.51 
 
 
892 aa  585  1.0000000000000001e-165  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  36.09 
 
 
885 aa  583  1.0000000000000001e-165  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  38.19 
 
 
903 aa  583  1.0000000000000001e-165  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.15 
 
 
892 aa  580  1e-164  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.77 
 
 
892 aa  582  1e-164  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.16 
 
 
916 aa  571  1e-161  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.57 
 
 
926 aa  572  1e-161  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  35.84 
 
 
906 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.66 
 
 
928 aa  565  1.0000000000000001e-159  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.94 
 
 
951 aa  563  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  37.34 
 
 
921 aa  559  1e-158  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.92 
 
 
897 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.83 
 
 
903 aa  559  1e-158  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  36.04 
 
 
911 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  37.55 
 
 
925 aa  558  1e-157  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.19 
 
 
908 aa  558  1e-157  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.74 
 
 
939 aa  558  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.63 
 
 
896 aa  555  1e-156  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.17 
 
 
946 aa  554  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.88 
 
 
903 aa  551  1e-155  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.01 
 
 
928 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  36.67 
 
 
903 aa  552  1e-155  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.2 
 
 
924 aa  551  1e-155  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.01 
 
 
928 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.79 
 
 
928 aa  550  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  36 
 
 
898 aa  551  1e-155  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  37.41 
 
 
928 aa  549  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  36.66 
 
 
932 aa  550  1e-155  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.2 
 
 
928 aa  546  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.3 
 
 
928 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.4 
 
 
899 aa  549  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.25 
 
 
897 aa  546  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  36.91 
 
 
936 aa  548  1e-154  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.4 
 
 
899 aa  549  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.25 
 
 
928 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  37.3 
 
 
928 aa  546  1e-154  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  37.35 
 
 
917 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  37.25 
 
 
913 aa  548  1e-154  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.91 
 
 
928 aa  548  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  36.88 
 
 
929 aa  543  1e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  36.7 
 
 
890 aa  542  1e-153  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  36.26 
 
 
922 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  35.38 
 
 
930 aa  540  9.999999999999999e-153  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  34.87 
 
 
979 aa  540  9.999999999999999e-153  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  36.96 
 
 
930 aa  540  9.999999999999999e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  35.59 
 
 
937 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.06 
 
 
946 aa  541  9.999999999999999e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  35.82 
 
 
908 aa  540  9.999999999999999e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  35.04 
 
 
897 aa  541  9.999999999999999e-153  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  35.05 
 
 
889 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  35.69 
 
 
936 aa  536  1e-151  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  34.96 
 
 
894 aa  536  1e-151  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.6 
 
 
949 aa  534  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  36.24 
 
 
908 aa  535  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  36.43 
 
 
912 aa  535  1e-150  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1930  DNA polymerase I  35.65 
 
 
927 aa  535  1e-150  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.173956  normal  0.0298694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  34.6 
 
 
955 aa  534  1e-150  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  36.54 
 
 
923 aa  536  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  34.69 
 
 
926 aa  529  1e-149  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  35.85 
 
 
943 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  35.03 
 
 
905 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  35.83 
 
 
904 aa  528  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.27 
 
 
940 aa  524  1e-147  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  35.07 
 
 
861 aa  523  1e-147  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  35.12 
 
 
943 aa  524  1e-147  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  35.99 
 
 
944 aa  524  1e-147  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  35.43 
 
 
924 aa  522  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  35.96 
 
 
945 aa  520  1e-146  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  35.35 
 
 
941 aa  520  1e-146  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  35.22 
 
 
921 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  35.67 
 
 
895 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  35.9 
 
 
917 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  35.57 
 
 
936 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  34.47 
 
 
949 aa  518  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  35.7 
 
 
944 aa  515  1e-144  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  34.49 
 
 
928 aa  513  1e-144  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  35.47 
 
 
965 aa  512  1e-143  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  35.88 
 
 
924 aa  509  1e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  35.48 
 
 
884 aa  507  9.999999999999999e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  36.8 
 
 
885 aa  509  9.999999999999999e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  51.71 
 
 
883 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  34.44 
 
 
939 aa  505  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  33.99 
 
 
908 aa  500  1e-140  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>