More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2019 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013515  Smon_1103  DNA polymerase I  49.55 
 
 		 861 aa  775    Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  100 
 
 		 885 aa  1781    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.82 
 
 		 850 aa  560  1e-158  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  37.86 
 
 		 877 aa  553  1e-156  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.25 
 
 		 878 aa  544  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 934 aa  535  1e-150  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.13 
 
 		 895 aa  534  1e-150  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.26 
 
 		 891 aa  532  1e-149  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 924 aa  531  1e-149  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 872 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 891 aa  529  1e-149  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 891 aa  530  1e-149  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 877 aa  530  1e-149  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 951 aa  529  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 877 aa  530  1e-149  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 877 aa  528  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 891 aa  528  1e-148  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  35.39 
 
 		 903 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.34 
 
 		 929 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 877 aa  526  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 929 aa  526  1e-148  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 868 aa  528  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 877 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 877 aa  523  1e-147  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.39 
 
 		 877 aa  520  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 891 aa  520  1e-146  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 944 aa  520  1e-146  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 903 aa  520  1e-146  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  37.4 
 
 		 879 aa  520  1e-146  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 911 aa  520  1e-146  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  34.96 
 
 		 903 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 936 aa  516  1.0000000000000001e-145  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.12 
 
 		 885 aa  516  1.0000000000000001e-145  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  37.18 
 
 		 924 aa  516  1.0000000000000001e-145  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 876 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 893 aa  518  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 893 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.4 
 
 		 902 aa  516  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 876 aa  516  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.33 
 
 		 903 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  36.72 
 
 		 896 aa  516  1.0000000000000001e-145  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 902 aa  513  1e-144  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 896 aa  513  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  35.68 
 
 		 892 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 892 aa  513  1e-144  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 939 aa  516  1e-144  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 876 aa  510  1e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 896 aa  510  1e-143  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 928 aa  511  1e-143  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 916 aa  511  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 928 aa  510  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 932 aa  511  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  34.39 
 
 		 924 aa  509  9.999999999999999e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 945 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 866 aa  506  9.999999999999999e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  35.94 
 
 		 928 aa  504  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 928 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 934 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  35.34 
 
 		 939 aa  504  1e-141  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  34 
 
 		 933 aa  503  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 928 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 928 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 932 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 932 aa  504  1e-141  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 928 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 866 aa  504  1e-141  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  34.42 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  34.45 
 
 		 922 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  34.34 
 
 		 922 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 932 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 946 aa  503  1e-141  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 922 aa  501  1e-140  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  34.42 
 
 		 949 aa  502  1e-140  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.36 
 
 		 930 aa  501  1e-140  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 930 aa  500  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  34.35 
 
 		 956 aa  499  1e-139  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 875 aa  498  1e-139  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  33.87 
 
 		 903 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  37 
 
 		 945 aa  498  1e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 935 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 939 aa  496  1e-139  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 943 aa  498  1e-139  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  34.98 
 
 		 908 aa  499  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 921 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  34.45 
 
 		 921 aa  496  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  34.56 
 
 		 921 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 930 aa  499  1e-139  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 931 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 950 aa  496  1e-139  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  34.08 
 
 		 933 aa  495  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  34.37 
 
 		 926 aa  495  9.999999999999999e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>