More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCAP_0636 on replicon NC_007633
Organism: Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006055  Mfl582  DNA polymerase I  49.51 
 
 		 895 aa  866    Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0335993  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0636  DNA polymerase I  100 
 
 		 911 aa  1831    Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.2885  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 877 aa  615  1e-175  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 877 aa  616  1e-175  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 877 aa  616  1e-175  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.77 
 
 		 877 aa  616  1e-175  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.92 
 
 		 877 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 891 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 891 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 891 aa  614  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 877 aa  615  9.999999999999999e-175  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 877 aa  612  1e-173  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 877 aa  612  1e-173  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 878 aa  597  1e-169  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 876 aa  566  1e-160  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 877 aa  535  1e-150  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 876 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.43 
 
 		 876 aa  531  1e-149  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 872 aa  530  1e-149  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 888 aa  529  1e-149  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  33.05 
 
 		 895 aa  528  1e-148  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 880 aa  523  1e-147  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  35.59 
 
 		 894 aa  523  1e-147  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 883 aa  520  1e-146  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 870 aa  519  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.32 
 
 		 879 aa  521  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 876 aa  518  1.0000000000000001e-145  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 896 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 850 aa  510  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 903 aa  509  9.999999999999999e-143  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 896 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 878 aa  504  1e-141  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 888 aa  501  1e-140  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  33.97 
 
 		 893 aa  502  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  35.18 
 
 		 879 aa  495  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 866 aa  493  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 866 aa  491  1e-137  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 903 aa  481  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  33.19 
 
 		 866 aa  480  1e-134  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  29.95 
 
 		 901 aa  474  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  32.77 
 
 		 950 aa  470  1.0000000000000001e-131  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  31.61 
 
 		 903 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  31.91 
 
 		 891 aa  466  1e-129  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 855 aa  466  1e-129  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  31.08 
 
 		 924 aa  465  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  32 
 
 		 956 aa  462  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  32.66 
 
 		 936 aa  462  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  32.1 
 
 		 891 aa  461  9.999999999999999e-129  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  32.4 
 
 		 892 aa  461  9.999999999999999e-129  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  32.38 
 
 		 893 aa  459  9.999999999999999e-129  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  32.55 
 
 		 885 aa  459  9.999999999999999e-129  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 896 aa  462  9.999999999999999e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  31.5 
 
 		 903 aa  457  1e-127  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 911 aa  457  1e-127  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  31.32 
 
 		 903 aa  458  1e-127  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  30.28 
 
 		 949 aa  457  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  32.91 
 
 		 946 aa  459  1e-127  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  31.69 
 
 		 873 aa  454  1.0000000000000001e-126  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  31.39 
 
 		 928 aa  450  1e-125  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  32.46 
 
 		 926 aa  450  1e-125  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 943 aa  449  1.0000000000000001e-124  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  30.72 
 
 		 910 aa  449  1.0000000000000001e-124  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  32.05 
 
 		 929 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  30.56 
 
 		 936 aa  445  1e-123  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 892 aa  443  1e-123  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  31.05 
 
 		 916 aa  445  1e-123  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  31.17 
 
 		 928 aa  443  1e-123  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  30.5 
 
 		 893 aa  441  9.999999999999999e-123  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 908 aa  441  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  32.57 
 
 		 930 aa  442  9.999999999999999e-123  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  30.06 
 
 		 940 aa  441  9.999999999999999e-123  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  32.64 
 
 		 944 aa  442  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  31.68 
 
 		 929 aa  441  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  31.32 
 
 		 888 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  31.23 
 
 		 892 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  29.08 
 
 		 909 aa  440  9.999999999999999e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 885 aa  440  9.999999999999999e-123  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  31.24 
 
 		 875 aa  440  9.999999999999999e-123  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 898 aa  439  9.999999999999999e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  29.42 
 
 		 908 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  31.1 
 
 		 939 aa  439  1e-121  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  31.44 
 
 		 892 aa  439  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  32.42 
 
 		 928 aa  439  1e-121  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  31.36 
 
 		 951 aa  437  1e-121  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  30.18 
 
 		 939 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 892 aa  438  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  29.3 
 
 		 906 aa  436  1e-120  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  28.51 
 
 		 910 aa  435  1e-120  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  29.76 
 
 		 901 aa  433  1e-120  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  30.03 
 
 		 905 aa  434  1e-120  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  28.07 
 
 		 897 aa  434  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  28 
 
 		 912 aa  433  1e-120  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  28.76 
 
 		 926 aa  432  1e-119  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  29.71 
 
 		 936 aa  432  1e-119  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  28.3 
 
 		 933 aa  431  1e-119  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  30.93 
 
 		 902 aa  430  1e-119  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  31.73 
 
 		 945 aa  432  1e-119  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  31.6 
 
 		 902 aa  430  1e-119  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  31.46 
 
 		 893 aa  430  1e-119  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  31.03 
 
 		 921 aa  429  1e-119  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>