More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_2017 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  40.83 
 
 		 892 aa  637    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  40.86 
 
 		 903 aa  662    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  41.36 
 
 		 891 aa  652    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  40.98 
 
 		 892 aa  637    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  43.07 
 
 		 876 aa  718    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  44.42 
 
 		 896 aa  715    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 892 aa  637    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  44.52 
 
 		 877 aa  756    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  41.62 
 
 		 880 aa  644    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  44.52 
 
 		 877 aa  751    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  42.64 
 
 		 903 aa  640    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 891 aa  756    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 891 aa  756    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  44.44 
 
 		 891 aa  755    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 892 aa  637    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  44.52 
 
 		 877 aa  756    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  41.29 
 
 		 903 aa  657    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  46.74 
 
 		 870 aa  760    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  47.47 
 
 		 876 aa  776    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 888 aa  660    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 903 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  43.58 
 
 		 872 aa  734    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 891 aa  682    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  43.68 
 
 		 873 aa  689    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  44.53 
 
 		 877 aa  752    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  42.59 
 
 		 892 aa  639    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  46.28 
 
 		 895 aa  757    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  44.41 
 
 		 877 aa  756    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  44.41 
 
 		 877 aa  756    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  47.35 
 
 		 883 aa  794    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  45.23 
 
 		 894 aa  747    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  45.8 
 
 		 885 aa  751    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  46.22 
 
 		 878 aa  732    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  44.29 
 
 		 877 aa  754    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.86 
 
 		 926 aa  649    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  44.97 
 
 		 868 aa  695    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  42.4 
 
 		 850 aa  652    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  43.91 
 
 		 876 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  42.63 
 
 		 866 aa  694    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  42.97 
 
 		 866 aa  697    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  100 
 
 		 866 aa  1768    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  45.59 
 
 		 878 aa  778    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  46.54 
 
 		 888 aa  755    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 877 aa  659    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  41.95 
 
 		 896 aa  678    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  40.45 
 
 		 893 aa  643    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  41.38 
 
 		 879 aa  640    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  43.91 
 
 		 876 aa  732    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.13 
 
 		 902 aa  637    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  44.63 
 
 		 877 aa  761    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.02 
 
 		 893 aa  638    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.98 
 
 		 879 aa  709    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 929 aa  635  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 888 aa  632  1e-180  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  42.9 
 
 		 912 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  39.87 
 
 		 903 aa  635  1e-180  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  42.42 
 
 		 903 aa  631  1e-179  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  40.47 
 
 		 934 aa  628  1e-178  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 934 aa  625  1e-178  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 951 aa  623  1e-177  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.28 
 
 		 928 aa  624  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  41.29 
 
 		 896 aa  621  1e-176  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  41.18 
 
 		 896 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 929 aa  620  1e-176  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 978 aa  617  1e-175  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 935 aa  617  1e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  40.74 
 
 		 928 aa  614  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  39.65 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  38.69 
 
 		 979 aa  613  9.999999999999999e-175  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  40.32 
 
 		 930 aa  615  9.999999999999999e-175  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  40.48 
 
 		 928 aa  612  9.999999999999999e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.46 
 
 		 911 aa  614  9.999999999999999e-175  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  40.63 
 
 		 928 aa  613  9.999999999999999e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 930 aa  609  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 932 aa  612  1e-173  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 928 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 928 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.68 
 
 		 917 aa  610  1e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 928 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 928 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.79 
 
 		 913 aa  612  1e-173  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  39.54 
 
 		 928 aa  611  1e-173  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 932 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 893 aa  606  9.999999999999999e-173  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  40.82 
 
 		 908 aa  608  9.999999999999999e-173  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  40.75 
 
 		 904 aa  606  9.999999999999999e-173  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  39.52 
 
 		 930 aa  608  9.999999999999999e-173  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 932 aa  607  9.999999999999999e-173  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 932 aa  608  9.999999999999999e-173  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  40.43 
 
 		 934 aa  606  9.999999999999999e-173  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  40 
 
 		 875 aa  604  1.0000000000000001e-171  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  40.18 
 
 		 893 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 906 aa  603  1.0000000000000001e-171  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>