More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_0886 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  47.65 
 
 		 878 aa  802    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  39.34 
 
 		 903 aa  660    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 891 aa  656    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  44.27 
 
 		 876 aa  725    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  44.98 
 
 		 877 aa  770    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.29 
 
 		 880 aa  655    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  48.54 
 
 		 872 aa  804    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  46.37 
 
 		 876 aa  767    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 891 aa  768    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 891 aa  768    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  45.76 
 
 		 877 aa  767    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 891 aa  768    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  45.6 
 
 		 870 aa  759    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  41.32 
 
 		 994 aa  652    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  45.99 
 
 		 888 aa  759    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.91 
 
 		 891 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 877 aa  766    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  42.56 
 
 		 895 aa  739    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  45.1 
 
 		 877 aa  768    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 892 aa  646    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  40.53 
 
 		 936 aa  636    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 877 aa  769    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  44.87 
 
 		 877 aa  769    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  100 
 
 		 894 aa  1813    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  42.92 
 
 		 868 aa  694    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 875 aa  635    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  47.3 
 
 		 883 aa  818    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  45.04 
 
 		 885 aa  753    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 903 aa  661    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 888 aa  668    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  44.91 
 
 		 877 aa  769    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  40.22 
 
 		 926 aa  642    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  60.96 
 
 		 896 aa  1068    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  45.43 
 
 		 877 aa  770    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 892 aa  665    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  47.03 
 
 		 850 aa  771    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  44.24 
 
 		 878 aa  748    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  39.69 
 
 		 892 aa  649    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  43.06 
 
 		 879 aa  722    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  45.75 
 
 		 876 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  49.67 
 
 		 866 aa  827    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  49.44 
 
 		 866 aa  821    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  45.23 
 
 		 866 aa  747    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  43.6 
 
 		 873 aa  697    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 877 aa  667    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 903 aa  640    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  42.13 
 
 		 896 aa  687    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  42.87 
 
 		 893 aa  687    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  41.88 
 
 		 879 aa  644    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  39.57 
 
 		 939 aa  650    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  41.53 
 
 		 893 aa  649    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 902 aa  668    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  41.97 
 
 		 893 aa  652    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.9 
 
 		 903 aa  658    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 893 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  45.75 
 
 		 876 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  39.89 
 
 		 878 aa  635  1e-180  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.19 
 
 		 911 aa  626  1e-178  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 892 aa  620  1e-176  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 901 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 924 aa  620  1e-176  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 932 aa  615  1e-175  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  37.04 
 
 		 906 aa  618  1e-175  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 892 aa  617  1e-175  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 917 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  38.09 
 
 		 944 aa  613  9.999999999999999e-175  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 903 aa  613  9.999999999999999e-175  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  39.4 
 
 		 926 aa  614  9.999999999999999e-175  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  38.15 
 
 		 946 aa  613  9.999999999999999e-175  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 913 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 946 aa  612  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  37.6 
 
 		 930 aa  610  1e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 920 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 893 aa  611  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 939 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 950 aa  609  1e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 920 aa  611  1e-173  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 888 aa  608  9.999999999999999e-173  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 908 aa  608  9.999999999999999e-173  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.78 
 
 		 909 aa  607  9.999999999999999e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 929 aa  605  9.999999999999999e-173  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 915 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 943 aa  606  9.999999999999999e-173  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 910 aa  607  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  39.31 
 
 		 915 aa  603  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.27 
 
 		 903 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  39.53 
 
 		 898 aa  605  1.0000000000000001e-171  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  39.05 
 
 		 915 aa  601  1e-170  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.67 
 
 		 926 aa  602  1e-170  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  37.88 
 
 		 908 aa  599  1e-170  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  37.96 
 
 		 921 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 935 aa  599  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 949 aa  600  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.91 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 928 aa  600  1e-170  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 915 aa  600  1e-170  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>