More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_04860 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  44.67 
 
 		 896 aa  737    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  42.18 
 
 		 903 aa  691    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  43.4 
 
 		 891 aa  704    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  46.17 
 
 		 876 aa  733    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  42.22 
 
 		 888 aa  679    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  47.91 
 
 		 877 aa  817    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  41.31 
 
 		 901 aa  662    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  41.42 
 
 		 908 aa  641    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  40.31 
 
 		 929 aa  638    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  44.03 
 
 		 895 aa  725    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  47.91 
 
 		 891 aa  817    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  47.91 
 
 		 891 aa  817    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  48.03 
 
 		 877 aa  818    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  47.91 
 
 		 891 aa  816    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  41.48 
 
 		 888 aa  641    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  45.61 
 
 		 850 aa  710    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  41.28 
 
 		 906 aa  659    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  43.19 
 
 		 892 aa  691    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  47.91 
 
 		 877 aa  815    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  42.21 
 
 		 892 aa  671    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  47.67 
 
 		 872 aa  782    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  47.55 
 
 		 883 aa  800    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  41.05 
 
 		 903 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  42.01 
 
 		 930 aa  660    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  47.58 
 
 		 877 aa  809    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  45.35 
 
 		 891 aa  754    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  100 
 
 		 870 aa  1763    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  45.6 
 
 		 894 aa  759    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  43.37 
 
 		 892 aa  681    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  43.09 
 
 		 903 aa  694    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  48.03 
 
 		 877 aa  818    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  45.9 
 
 		 876 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  46.8 
 
 		 885 aa  766    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 945 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  45.9 
 
 		 876 aa  752    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  46.79 
 
 		 877 aa  800    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  43.64 
 
 		 892 aa  695    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  43.27 
 
 		 892 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  40.3 
 
 		 928 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  42.62 
 
 		 893 aa  662    Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  48.3 
 
 		 877 aa  816    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  47.03 
 
 		 888 aa  769    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  41.86 
 
 		 878 aa  669    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  41.69 
 
 		 875 aa  657    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 920 aa  639    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  47.03 
 
 		 868 aa  748    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  49.6 
 
 		 866 aa  782    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  49.71 
 
 		 866 aa  788    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  46.15 
 
 		 873 aa  736    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 903 aa  635    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  42.95 
 
 		 893 aa  660    Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  42.29 
 
 		 903 aa  687    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  46.74 
 
 		 866 aa  760    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  45.96 
 
 		 878 aa  747    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  42.73 
 
 		 879 aa  679    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  42.46 
 
 		 877 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0673  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 903 aa  635    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.605668  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  43.67 
 
 		 896 aa  692    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  43.53 
 
 		 893 aa  666    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  43.48 
 
 		 879 aa  654    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  48.03 
 
 		 877 aa  818    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  43.32 
 
 		 902 aa  656    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  41.03 
 
 		 911 aa  649    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  42.11 
 
 		 893 aa  649    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 924 aa  667    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  48.31 
 
 		 876 aa  791    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  49.72 
 
 		 878 aa  840    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  40.38 
 
 		 920 aa  639    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  40.14 
 
 		 911 aa  649    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  42.71 
 
 		 880 aa  634  1e-180  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.79 
 
 		 884 aa  634  1e-180  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  40.79 
 
 		 909 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  39.58 
 
 		 902 aa  631  1e-179  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  43.4 
 
 		 855 aa  629  1e-179  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  41.83 
 
 		 893 aa  632  1e-179  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  40.16 
 
 		 905 aa  631  1e-179  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  39.8 
 
 		 928 aa  625  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  41.3 
 
 		 926 aa  625  1e-178  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  40.46 
 
 		 928 aa  623  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  42.41 
 
 		 917 aa  624  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  40.52 
 
 		 916 aa  619  1e-176  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  40.99 
 
 		 846 aa  621  1e-176  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  40.71 
 
 		 896 aa  620  1e-176  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  39.94 
 
 		 932 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  39.22 
 
 		 951 aa  619  1e-176  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 885 aa  620  1e-176  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 910 aa  622  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  38.84 
 
 		 912 aa  618  1e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  40.62 
 
 		 929 aa  617  1e-175  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  39.13 
 
 		 899 aa  618  1e-175  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  41.33 
 
 		 917 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  39.24 
 
 		 899 aa  615  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  41.16 
 
 		 915 aa  617  1e-175  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 904 aa  617  1e-175  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  41.44 
 
 		 913 aa  618  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  39.81 
 
 		 926 aa  613  9.999999999999999e-175  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 893 aa  612  9.999999999999999e-175  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  40.8 
 
 		 896 aa  614  9.999999999999999e-175  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>