More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_12990 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  53.56 
 
 
912 aa  888    Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  41.59 
 
 
877 aa  646    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  58.85 
 
 
885 aa  1045    Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  41.59 
 
 
891 aa  647    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  41.59 
 
 
891 aa  648    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  41.59 
 
 
891 aa  647    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  100 
 
 
878 aa  1791    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  40.87 
 
 
883 aa  655    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  38.56 
 
 
872 aa  644    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  41.7 
 
 
877 aa  648    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  41.38 
 
 
877 aa  644    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  41.78 
 
 
885 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  39.89 
 
 
894 aa  646    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  41.7 
 
 
877 aa  647    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  41.89 
 
 
877 aa  660    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  66.74 
 
 
875 aa  1191    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  41.4 
 
 
877 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  41.86 
 
 
878 aa  680    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  41.18 
 
 
866 aa  668    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  41.52 
 
 
866 aa  672    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  40.09 
 
 
896 aa  638    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  41.97 
 
 
870 aa  673    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  41.7 
 
 
877 aa  648    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  41.18 
 
 
877 aa  646    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  40.77 
 
 
868 aa  636    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.84 
 
 
850 aa  626  1e-178  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  42.09 
 
 
878 aa  622  1e-176  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  40.13 
 
 
876 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  40.13 
 
 
876 aa  621  1e-176  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  40.66 
 
 
873 aa  616  1e-175  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.3 
 
 
891 aa  609  1e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  39.14 
 
 
896 aa  607  9.999999999999999e-173  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.5 
 
 
884 aa  597  1e-169  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  38.56 
 
 
866 aa  598  1e-169  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  38.94 
 
 
855 aa  592  1e-167  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  39.02 
 
 
901 aa  588  1e-166  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  38.46 
 
 
906 aa  586  1e-166  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  38.48 
 
 
877 aa  586  1e-166  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.6 
 
 
893 aa  587  1e-166  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.86 
 
 
888 aa  582  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.05 
 
 
893 aa  582  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.74 
 
 
926 aa  576  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.86 
 
 
903 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  39.3 
 
 
892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.03 
 
 
892 aa  573  1.0000000000000001e-162  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.12 
 
 
903 aa  566  1e-160  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.15 
 
 
903 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.32 
 
 
892 aa  566  1e-160  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  35.91 
 
 
932 aa  565  1.0000000000000001e-159  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.13 
 
 
926 aa  562  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  37.4 
 
 
880 aa  559  1e-158  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.6 
 
 
903 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  38.49 
 
 
934 aa  560  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  39.86 
 
 
843 aa  561  1e-158  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  38.93 
 
 
931 aa  560  1e-158  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.49 
 
 
940 aa  559  1e-158  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.25 
 
 
893 aa  557  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  37.42 
 
 
910 aa  554  1e-156  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.93 
 
 
903 aa  552  1e-156  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.63 
 
 
934 aa  554  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.95 
 
 
928 aa  555  1e-156  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  37.83 
 
 
899 aa  554  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  38.25 
 
 
917 aa  555  1e-156  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.01 
 
 
930 aa  552  1e-155  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  37.38 
 
 
916 aa  550  1e-155  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.04 
 
 
946 aa  550  1e-155  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  37.09 
 
 
912 aa  550  1e-155  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  38.49 
 
 
906 aa  548  1e-154  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.51 
 
 
932 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  37.25 
 
 
893 aa  546  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.51 
 
 
932 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.51 
 
 
932 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  38.25 
 
 
928 aa  546  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  37.09 
 
 
909 aa  546  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  37.77 
 
 
928 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  37.64 
 
 
899 aa  544  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.58 
 
 
929 aa  545  1e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.46 
 
 
924 aa  545  1e-153  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  37.14 
 
 
933 aa  543  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.65 
 
 
928 aa  544  1e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  36.98 
 
 
905 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  36.91 
 
 
908 aa  545  1e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.54 
 
 
930 aa  539  9.999999999999999e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  37.42 
 
 
911 aa  541  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.34 
 
 
943 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.6 
 
 
899 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.6 
 
 
899 aa  541  9.999999999999999e-153  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.39 
 
 
928 aa  540  9.999999999999999e-153  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.96 
 
 
930 aa  539  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  37.54 
 
 
928 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  37.28 
 
 
889 aa  539  9.999999999999999e-153  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.97 
 
 
939 aa  536  1e-151  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.83 
 
 
946 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>