More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0959 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2200  DNA polymerase I  57.89 
 
 		 910 aa  979    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.759934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1802  DNA polymerase I  52.41 
 
 		 894 aa  869    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000838871 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1969  DNA polymerase I  57.69 
 
 		 908 aa  904    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.223022  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0959  DNA polymerase I  100 
 
 		 928 aa  1862    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.75162 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3769  DNA polymerase I  58.99 
 
 		 908 aa  994    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0220988 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  69.02 
 
 		 929 aa  1228    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1509  DNA polymerase I  56.32 
 
 		 905 aa  879    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  54.35 
 
 		 893 aa  915    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3037  DNA polymerase I  54.29 
 
 		 902 aa  874    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000203838  normal  0.011117 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  57.69 
 
 		 901 aa  985    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  59.87 
 
 		 899 aa  1013    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2886  DNA polymerase I  53.19 
 
 		 949 aa  889    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.725232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  54.19 
 
 		 909 aa  932    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  52.95 
 
 		 929 aa  905    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1621  DNA polymerase I  60.11 
 
 		 945 aa  1024    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.924074 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20220  DNA polymerase I  57.63 
 
 		 901 aa  937    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.232173 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2445  DNA polymerase I  54.15 
 
 		 917 aa  873    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0738  DNA polymerase I  46.96 
 
 		 955 aa  754    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5532  DNA polymerase I  56.61 
 
 		 888 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2951  DNA polymerase I  59.33 
 
 		 933 aa  1009    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.04792  normal  0.12878 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5677  DNA polymerase I  55.21 
 
 		 905 aa  927    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.902906  normal  0.469276 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2966  DNA-directed DNA polymerase  59.39 
 
 		 901 aa  990    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.254596  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11645  DNA polymerase I  55.45 
 
 		 904 aa  902    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.693039 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  59.56 
 
 		 911 aa  1026    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  53.47 
 
 		 920 aa  914    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12970  DNA polymerase I  56.58 
 
 		 904 aa  909    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.199065  normal  0.445592 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  59.28 
 
 		 899 aa  1014    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  57.11 
 
 		 912 aa  971    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11120  DNA polymerase I  50.8 
 
 		 937 aa  811    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.249586  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2063  DNA polymerase I  52.03 
 
 		 955 aa  875    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.045949  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  60.43 
 
 		 906 aa  1064    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1088  DNA polymerase I  60.83 
 
 		 910 aa  1002    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.100396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  58.13 
 
 		 893 aa  996    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3006  DNA polymerase I  58.33 
 
 		 889 aa  1012    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  53.47 
 
 		 920 aa  914    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  54.74 
 
 		 908 aa  926    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  39.76 
 
 		 870 aa  628  1e-178  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  41.07 
 
 		 903 aa  609  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  41.06 
 
 		 912 aa  605  1.0000000000000001e-171  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 878 aa  594  1e-168  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 883 aa  592  1e-168  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 876 aa  590  1e-167  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 872 aa  587  1e-166  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.26 
 
 		 903 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.44 
 
 		 877 aa  579  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  40.17 
 
 		 876 aa  582  1e-164  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 866 aa  580  1e-164  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 866 aa  582  1e-164  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 895 aa  579  1e-164  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 891 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 891 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 891 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.01 
 
 		 877 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.98 
 
 		 876 aa  575  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.19 
 
 		 891 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.26 
 
 		 877 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  40.15 
 
 		 906 aa  570  1e-161  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  35.68 
 
 		 877 aa  571  1e-161  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  40.85 
 
 		 885 aa  565  1.0000000000000001e-159  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  38.67 
 
 		 902 aa  563  1.0000000000000001e-159  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 896 aa  560  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 902 aa  560  1e-158  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 866 aa  560  1e-158  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  38.16 
 
 		 896 aa  556  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.52 
 
 		 894 aa  556  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 939 aa  556  1e-157  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 878 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.59 
 
 		 902 aa  557  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  39 
 
 		 924 aa  555  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  39.98 
 
 		 897 aa  555  1e-156  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 888 aa  550  1e-155  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 911 aa  550  1e-155  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  40.2 
 
 		 897 aa  549  1e-155  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  40.09 
 
 		 897 aa  550  1e-155  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  39.12 
 
 		 904 aa  551  1e-155  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  38.51 
 
 		 940 aa  550  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 873 aa  546  1e-154  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 896 aa  547  1e-154  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  38.92 
 
 		 899 aa  548  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 896 aa  547  1e-154  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 903 aa  543  1e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  38.03 
 
 		 892 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 946 aa  543  1e-153  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  40.58 
 
 		 913 aa  544  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.72 
 
 		 903 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.43 
 
 		 908 aa  542  9.999999999999999e-153  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 891 aa  538  1e-151  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  40.04 
 
 		 917 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.87 
 
 		 899 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 892 aa  538  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.87 
 
 		 899 aa  536  1e-151  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  37.04 
 
 		 903 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 877 aa  538  1e-151  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 878 aa  535  1e-150  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 879 aa  534  1e-150  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>