More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_4231 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  48.37 
 
 		 976 aa  860    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  48.74 
 
 		 986 aa  903    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  47.46 
 
 		 976 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  60.29 
 
 		 977 aa  1177    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  49.8 
 
 		 998 aa  915    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  49.7 
 
 		 986 aa  900    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  48.17 
 
 		 976 aa  856    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  59.32 
 
 		 953 aa  1137    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  49.9 
 
 		 985 aa  913    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  100 
 
 		 966 aa  1982    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  59.02 
 
 		 982 aa  1140    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  69.34 
 
 		 972 aa  1348    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  69.34 
 
 		 972 aa  1348    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  48.74 
 
 		 986 aa  905    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  54.39 
 
 		 1045 aa  1072    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  58.65 
 
 		 982 aa  1142    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  50.91 
 
 		 986 aa  912    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  48.32 
 
 		 976 aa  865    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.14 
 
 		 891 aa  617  1e-175  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 956 aa  610  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.54 
 
 		 892 aa  610  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 949 aa  604  1.0000000000000001e-171  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  39 
 
 		 928 aa  602  1.0000000000000001e-171  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.07 
 
 		 936 aa  602  1e-170  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 893 aa  596  1e-169  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  39.28 
 
 		 870 aa  597  1e-169  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  594  1e-168  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  39.36 
 
 		 893 aa  595  1e-168  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-168  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  39.34 
 
 		 929 aa  591  1e-167  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 932 aa  591  1e-167  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  39.2 
 
 		 928 aa  592  1e-167  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 929 aa  586  1e-166  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  39.1 
 
 		 928 aa  589  1e-166  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 965 aa  583  1.0000000000000001e-165  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  583  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  584  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 931 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  38.62 
 
 		 928 aa  583  1.0000000000000001e-165  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  38.36 
 
 		 932 aa  582  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 930 aa  582  1e-164  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 939 aa  580  1e-164  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  38.27 
 
 		 934 aa  580  1e-164  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  38.53 
 
 		 893 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 951 aa  580  1e-164  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 936 aa  581  1e-164  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.08 
 
 		 892 aa  582  1e-164  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  37.5 
 
 		 903 aa  578  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38 
 
 		 903 aa  577  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.4 
 
 		 926 aa  577  1.0000000000000001e-163  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  38.35 
 
 		 944 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 892 aa  577  1.0000000000000001e-163  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.76 
 
 		 939 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  38.3 
 
 		 950 aa  578  1.0000000000000001e-163  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  38.69 
 
 		 924 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.31 
 
 		 939 aa  576  1.0000000000000001e-163  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.95 
 
 		 926 aa  578  1.0000000000000001e-163  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 963 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  38.39 
 
 		 883 aa  574  1.0000000000000001e-162  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.72 
 
 		 903 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 935 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 916 aa  575  1.0000000000000001e-162  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  39.08 
 
 		 945 aa  574  1.0000000000000001e-162  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 888 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 972 aa  574  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  38.02 
 
 		 930 aa  573  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 892 aa  575  1.0000000000000001e-162  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 911 aa  575  1.0000000000000001e-162  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 941 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  38.8 
 
 		 943 aa  572  1e-161  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 903 aa  572  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 957 aa  571  1e-161  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 953 aa  570  1e-161  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  37.22 
 
 		 930 aa  569  1e-161  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 924 aa  568  1e-160  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 915 aa  568  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 896 aa  567  1e-160  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 928 aa  567  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 903 aa  567  1e-160  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 896 aa  564  1.0000000000000001e-159  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  38.89 
 
 		 908 aa  565  1.0000000000000001e-159  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 915 aa  562  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.36 
 
 		 928 aa  564  1.0000000000000001e-159  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 946 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  37.74 
 
 		 933 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 922 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  37.51 
 
 		 946 aa  565  1.0000000000000001e-159  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  37.91 
 
 		 922 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  36.16 
 
 		 906 aa  561  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 934 aa  561  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  36.82 
 
 		 936 aa  560  1e-158  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>