More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0693 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  58.66 
 
 		 976 aa  1201    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  58.27 
 
 		 976 aa  1200    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  65.43 
 
 		 986 aa  1328    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  77.45 
 
 		 986 aa  1526    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  65.33 
 
 		 986 aa  1327    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  49.45 
 
 		 977 aa  891    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  50.75 
 
 		 982 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  49.2 
 
 		 982 aa  886    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  100 
 
 		 998 aa  2019    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  84.07 
 
 		 986 aa  1675    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  58.47 
 
 		 976 aa  1195    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  58.07 
 
 		 976 aa  1193    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  56.01 
 
 		 953 aa  995    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  49.8 
 
 		 966 aa  906    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  65.93 
 
 		 985 aa  1369    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 972 aa  917    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  50.85 
 
 		 972 aa  917    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 1045 aa  851    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  38.57 
 
 		 911 aa  580  1e-164  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.04 
 
 		 891 aa  579  1.0000000000000001e-163  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.9 
 
 		 903 aa  571  1e-161  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.69 
 
 		 951 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  39.78 
 
 		 939 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.54 
 
 		 892 aa  560  1e-158  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 934 aa  561  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 936 aa  559  1e-157  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.7 
 
 		 931 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 916 aa  557  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.7 
 
 		 926 aa  559  1e-157  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  38.96 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 893 aa  558  1e-157  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 930 aa  554  1e-156  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 949 aa  555  1e-156  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 934 aa  553  1e-156  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  37.03 
 
 		 943 aa  550  1e-155  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  39.48 
 
 		 911 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 928 aa  548  1e-154  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  38.97 
 
 		 908 aa  543  1e-153  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  37.52 
 
 		 936 aa  543  1e-153  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  544  1e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.24 
 
 		 928 aa  543  1e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.2 
 
 		 930 aa  543  1e-153  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  37.24 
 
 		 945 aa  543  1e-153  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 924 aa  543  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 939 aa  543  1e-153  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 888 aa  543  1e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 956 aa  544  1e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 928 aa  545  1e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.07 
 
 		 944 aa  543  1e-153  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 963 aa  539  9.999999999999999e-153  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 950 aa  540  9.999999999999999e-153  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  36.84 
 
 		 896 aa  540  9.999999999999999e-153  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 941 aa  541  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  37.05 
 
 		 924 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 928 aa  542  9.999999999999999e-153  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.14 
 
 		 928 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 915 aa  537  1e-151  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 928 aa  539  1e-151  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 924 aa  536  1e-151  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  36.34 
 
 		 942 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 934 aa  538  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 928 aa  536  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 934 aa  537  1e-151  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 908 aa  537  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 946 aa  537  1e-151  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 896 aa  534  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 939 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  37.04 
 
 		 979 aa  533  1e-150  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  37.45 
 
 		 910 aa  534  1e-150  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.68 
 
 		 943 aa  530  1e-149  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 940 aa  530  1e-149  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 933 aa  530  1e-149  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  530  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.01 
 
 		 928 aa  531  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  38.6 
 
 		 899 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  37.94 
 
 		 917 aa  531  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 928 aa  532  1e-149  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 913 aa  532  1e-149  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  38.6 
 
 		 899 aa  531  1e-149  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  37.03 
 
 		 923 aa  532  1e-149  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 917 aa  526  1e-148  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.61 
 
 		 933 aa  526  1e-148  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 905 aa  528  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 915 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 932 aa  527  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 934 aa  528  1e-148  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 946 aa  529  1e-148  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  38.42 
 
 		 915 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  35.47 
 
 		 892 aa  528  1e-148  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  35.89 
 
 		 938 aa  526  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.23 
 
 		 932 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 932 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 936 aa  526  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>