More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_0850 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  59.82 
 
 
972 aa  1144    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  50.56 
 
 
986 aa  897    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  49.2 
 
 
985 aa  910    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  45.12 
 
 
976 aa  833    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  59.12 
 
 
982 aa  1173    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  47.84 
 
 
986 aa  899    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  61.71 
 
 
977 aa  1206    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  39.53 
 
 
891 aa  637    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  50.95 
 
 
998 aa  920    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  51.2 
 
 
986 aa  918    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  45.93 
 
 
976 aa  851    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  62.31 
 
 
953 aa  1163    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  47.84 
 
 
986 aa  901    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  45.52 
 
 
976 aa  838    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  45.56 
 
 
976 aa  844    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  59.82 
 
 
972 aa  1144    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  59.55 
 
 
966 aa  1140    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  100 
 
 
982 aa  2005    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  55.52 
 
 
1045 aa  668    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  39.38 
 
 
924 aa  619  1e-176  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  39.22 
 
 
936 aa  614  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  38.45 
 
 
946 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  38.62 
 
 
956 aa  612  1e-173  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.92 
 
 
891 aa  607  9.999999999999999e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  39.72 
 
 
950 aa  607  9.999999999999999e-173  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  38.15 
 
 
932 aa  608  9.999999999999999e-173  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  40.18 
 
 
945 aa  604  1.0000000000000001e-171  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.65 
 
 
892 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.78 
 
 
892 aa  601  1e-170  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  37.78 
 
 
943 aa  596  1e-169  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  39.84 
 
 
903 aa  598  1e-169  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  39.63 
 
 
924 aa  595  1e-169  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  38.92 
 
 
944 aa  598  1e-169  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.66 
 
 
892 aa  595  1e-168  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  36.44 
 
 
949 aa  593  1e-168  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  38.19 
 
 
965 aa  590  1e-167  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.74 
 
 
892 aa  589  1e-167  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.66 
 
 
951 aa  589  1e-167  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  38.13 
 
 
939 aa  588  1e-166  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.75 
 
 
893 aa  588  1e-166  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.19 
 
 
893 aa  585  1.0000000000000001e-165  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  38.23 
 
 
930 aa  583  1.0000000000000001e-165  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.22 
 
 
888 aa  583  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.23 
 
 
877 aa  582  1e-164  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.79 
 
 
892 aa  581  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.85 
 
 
893 aa  580  1e-164  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.33 
 
 
903 aa  576  1.0000000000000001e-163  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.78 
 
 
903 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.53 
 
 
902 aa  578  1.0000000000000001e-163  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  37.53 
 
 
905 aa  578  1.0000000000000001e-163  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  38.62 
 
 
939 aa  577  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  38.59 
 
 
936 aa  577  1.0000000000000001e-163  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.42 
 
 
902 aa  573  1.0000000000000001e-162  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.2 
 
 
903 aa  573  1.0000000000000001e-162  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.42 
 
 
928 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.34 
 
 
877 aa  574  1.0000000000000001e-162  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.9 
 
 
878 aa  571  1e-161  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.69 
 
 
928 aa  570  1e-161  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  36.79 
 
 
931 aa  569  1e-161  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.85 
 
 
935 aa  572  1e-161  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  36.82 
 
 
934 aa  569  1e-161  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  37.79 
 
 
928 aa  570  1e-161  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  36.33 
 
 
946 aa  570  1e-161  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  38.68 
 
 
928 aa  570  1e-161  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  36.35 
 
 
963 aa  570  1e-161  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.83 
 
 
903 aa  571  1e-161  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.98 
 
 
906 aa  568  1e-160  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  38.02 
 
 
972 aa  568  1e-160  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.23 
 
 
908 aa  568  1e-160  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.58 
 
 
932 aa  567  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.68 
 
 
932 aa  568  1e-160  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.55 
 
 
928 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  37.88 
 
 
934 aa  567  1e-160  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  37.65 
 
 
922 aa  567  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  38.01 
 
 
921 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  37.93 
 
 
921 aa  567  1e-160  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  38.08 
 
 
928 aa  566  1e-160  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  36.72 
 
 
953 aa  568  1e-160  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  37.97 
 
 
935 aa  568  1e-160  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.41 
 
 
928 aa  567  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.68 
 
 
932 aa  568  1e-160  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  37.05 
 
 
941 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.61 
 
 
939 aa  565  1.0000000000000001e-159  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  38.74 
 
 
926 aa  563  1.0000000000000001e-159  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  37.23 
 
 
910 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  37.31 
 
 
939 aa  564  1.0000000000000001e-159  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  37.83 
 
 
921 aa  565  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  37.63 
 
 
934 aa  563  1.0000000000000001e-159  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.74 
 
 
940 aa  565  1.0000000000000001e-159  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  35.82 
 
 
926 aa  560  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.93 
 
 
934 aa  559  1e-158  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>