More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_15881 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  48.24 
 
 		 982 aa  863    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  47.93 
 
 		 982 aa  895    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  97.87 
 
 		 986 aa  1959    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  63.72 
 
 		 976 aa  1256    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  48.14 
 
 		 977 aa  881    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  65.43 
 
 		 998 aa  1328    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  65.38 
 
 		 986 aa  1323    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  48.44 
 
 		 966 aa  892    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  62.37 
 
 		 976 aa  1236    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  52.43 
 
 		 953 aa  962    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  50.55 
 
 		 972 aa  917    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  50.55 
 
 		 972 aa  917    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  67.34 
 
 		 985 aa  1352    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  62.32 
 
 		 976 aa  1236    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  100 
 
 		 986 aa  1998    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  66.63 
 
 		 986 aa  1330    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  43.35 
 
 		 1045 aa  805    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  62.6 
 
 		 976 aa  1243    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 892 aa  598  1e-169  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.71 
 
 		 891 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 951 aa  578  1.0000000000000001e-163  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 939 aa  567  1e-160  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 893 aa  568  1e-160  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 891 aa  565  1.0000000000000001e-159  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 944 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 930 aa  559  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.12 
 
 		 911 aa  561  1e-158  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 930 aa  556  1e-157  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 903 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 934 aa  558  1e-157  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  35.85 
 
 		 912 aa  558  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  36.57 
 
 		 916 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 934 aa  552  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.21 
 
 		 926 aa  554  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 950 aa  554  1e-156  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 908 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  35.73 
 
 		 906 aa  552  1e-155  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 910 aa  551  1e-155  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.55 
 
 		 934 aa  549  1e-155  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  37 
 
 		 936 aa  548  1e-154  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  35.03 
 
 		 915 aa  549  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  38.25 
 
 		 935 aa  547  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  36.96 
 
 		 945 aa  547  1e-154  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 928 aa  547  1e-154  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.46 
 
 		 911 aa  546  1e-154  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  35.96 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.37 
 
 		 892 aa  545  1e-153  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.3 
 
 		 892 aa  545  1e-153  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  544  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 917 aa  545  1e-153  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  545  1e-153  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 923 aa  543  1e-153  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 946 aa  543  1e-153  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 943 aa  540  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 992 aa  540  9.999999999999999e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 942 aa  540  9.999999999999999e-153  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 939 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 917 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 917 aa  542  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 888 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 913 aa  538  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 934 aa  536  1e-151  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  35.6 
 
 		 926 aa  538  1e-151  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  37.36 
 
 		 915 aa  538  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 917 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 917 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 917 aa  537  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 936 aa  535  1e-150  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 908 aa  534  1e-150  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 976 aa  535  1e-150  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 896 aa  533  1e-150  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  35.48 
 
 		 896 aa  535  1e-150  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  34.97 
 
 		 924 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  34.38 
 
 		 913 aa  535  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  36.02 
 
 		 928 aa  533  1e-150  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  37.99 
 
 		 870 aa  534  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 913 aa  533  1e-150  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 902 aa  535  1e-150  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  35.31 
 
 		 949 aa  535  1e-150  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 902 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  35.81 
 
 		 928 aa  530  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  35.63 
 
 		 924 aa  529  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 932 aa  531  1e-149  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 893 aa  530  1e-149  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 915 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 917 aa  532  1e-149  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 932 aa  530  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 963 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 932 aa  531  1e-149  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  36.22 
 
 		 936 aa  527  1e-148  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  34.68 
 
 		 968 aa  526  1e-148  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  36.96 
 
 		 915 aa  527  1e-148  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 924 aa  528  1e-148  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.78 
 
 		 928 aa  527  1e-148  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>