More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_0546 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_0136  DNA polymerase I  54.45 
 
 		 982 aa  1123    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.3801  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15881  DNA polymerase I  43.35 
 
 		 986 aa  805    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.65374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0748  DNA polymerase I  43.59 
 
 		 986 aa  812    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.100174  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0581  DNA polymerase I  55.15 
 
 		 977 aa  1116    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  56.58 
 
 		 972 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0693  DNA polymerase I  44.73 
 
 		 998 aa  851    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.433628  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1966  DNA polymerase I  44.68 
 
 		 986 aa  833    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.378529 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1236  DNA polymerase I  46.05 
 
 		 976 aa  835    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.206272  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  49.9 
 
 		 953 aa  984    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_08691  DNA polymerase I  45 
 
 		 986 aa  837    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  56.58 
 
 		 972 aa  649    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0546  DNA polymerase I  100 
 
 		 1045 aa  2135    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0850  DNA polymerase I  55.35 
 
 		 982 aa  650    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0300789 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12141  DNA polymerase I  46.2 
 
 		 985 aa  864    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.503839 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  45.16 
 
 		 976 aa  820    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4231  DNA polymerase I  52.53 
 
 		 966 aa  595  1e-168  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 936 aa  555  1e-156  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 943 aa  541  9.999999999999999e-153  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 950 aa  538  1e-151  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 924 aa  533  1e-150  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  34.03 
 
 		 911 aa  535  1e-150  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  34.06 
 
 		 903 aa  528  1e-148  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  34.28 
 
 		 936 aa  527  1e-148  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  33.15 
 
 		 891 aa  523  1e-147  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  33.87 
 
 		 903 aa  523  1e-147  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  34.16 
 
 		 932 aa  521  1e-146  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  33.87 
 
 		 930 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  33.52 
 
 		 926 aa  513  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 888 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  34.68 
 
 		 924 aa  509  9.999999999999999e-143  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  32.76 
 
 		 946 aa  507  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  32.76 
 
 		 877 aa  501  1e-140  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  33.52 
 
 		 902 aa  501  1e-140  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  33.4 
 
 		 903 aa  499  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  32.74 
 
 		 953 aa  499  1e-139  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  33.05 
 
 		 963 aa  495  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.19 
 
 		 872 aa  488  1e-136  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  485  1e-135  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  483  1e-135  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  32.61 
 
 		 939 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  32.86 
 
 		 928 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  33.08 
 
 		 939 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  32.64 
 
 		 930 aa  486  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  32.96 
 
 		 928 aa  484  1e-135  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  32.83 
 
 		 928 aa  482  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  32.59 
 
 		 951 aa  480  1e-134  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  32.13 
 
 		 903 aa  482  1e-134  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  32.8 
 
 		 936 aa  479  1e-133  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  32.41 
 
 		 930 aa  478  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  32.54 
 
 		 976 aa  477  1e-133  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  31.09 
 
 		 965 aa  477  1e-133  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  33.14 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  33.14 
 
 		 928 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  33.14 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  32.48 
 
 		 930 aa  473  1e-132  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  33.14 
 
 		 928 aa  474  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  33.14 
 
 		 928 aa  475  1e-132  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  31.81 
 
 		 992 aa  473  1e-132  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  32.67 
 
 		 928 aa  472  1.0000000000000001e-131  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  33.68 
 
 		 942 aa  473  1.0000000000000001e-131  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  31.71 
 
 		 957 aa  471  1.0000000000000001e-131  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  33.27 
 
 		 935 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  32.74 
 
 		 921 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  32.38 
 
 		 883 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  33.43 
 
 		 908 aa  471  1.0000000000000001e-131  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 945 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  31.79 
 
 		 945 aa  467  9.999999999999999e-131  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  32.45 
 
 		 933 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  33.24 
 
 		 908 aa  466  9.999999999999999e-131  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  32.96 
 
 		 943 aa  464  1e-129  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  31.17 
 
 		 912 aa  465  1e-129  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  32.73 
 
 		 896 aa  466  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  32.24 
 
 		 938 aa  463  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  32 
 
 		 979 aa  462  9.999999999999999e-129  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  31.85 
 
 		 908 aa  462  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_13291  DNA polymerase I  57.64 
 
 		 976 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_13151  DNA polymerase I  57.89 
 
 		 976 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  32.07 
 
 		 936 aa  457  1e-127  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1512  DNA polymerase I  30.08 
 
 		 972 aa  457  1e-127  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.43872  normal  0.0397579 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  31.65 
 
 		 978 aa  459  1e-127  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  31.34 
 
 		 979 aa  454  1.0000000000000001e-126  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  31.95 
 
 		 937 aa  456  1.0000000000000001e-126  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 910 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  31.94 
 
 		 928 aa  455  1.0000000000000001e-126  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  32.06 
 
 		 934 aa  454  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  31.62 
 
 		 923 aa  456  1.0000000000000001e-126  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 918 aa  452  1e-125  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  31.54 
 
 		 902 aa  451  1e-125  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  31.43 
 
 		 934 aa  451  1e-125  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  32.29 
 
 		 921 aa  450  1e-125  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  31.89 
 
 		 924 aa  449  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  32.2 
 
 		 922 aa  452  1e-125  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0378  DNA polymerase I  31.75 
 
 		 956 aa  446  1.0000000000000001e-124  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4103  DNA polymerase I  31.5 
 
 		 999 aa  449  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  32.11 
 
 		 921 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>