More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_1666 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008025  Dgeo_1666  DNA polymerase I  100 
 
 		 907 aa  1816    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0551454 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 877 aa  571  1e-161  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.83 
 
 		 883 aa  568  1e-160  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  36.74 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 891 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.85 
 
 		 877 aa  562  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  36.74 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 877 aa  563  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  36.85 
 
 		 877 aa  564  1.0000000000000001e-159  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 891 aa  562  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 891 aa  562  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  39.45 
 
 		 902 aa  556  1e-157  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  38.47 
 
 		 866 aa  552  1e-156  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 903 aa  549  1e-155  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 878 aa  547  1e-154  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  56.5 
 
 		 846 aa  546  1e-154  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  41.5 
 
 		 936 aa  543  1e-153  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 951 aa  544  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  39.16 
 
 		 940 aa  542  9.999999999999999e-153  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  36.85 
 
 		 939 aa  540  9.999999999999999e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  40.02 
 
 		 885 aa  536  1e-151  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  39.41 
 
 		 884 aa  537  1e-151  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37.55 
 
 		 902 aa  536  1e-151  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  38.67 
 
 		 903 aa  535  1e-150  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  40.91 
 
 		 939 aa  533  1e-150  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  38.4 
 
 		 903 aa  533  1e-150  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  38.61 
 
 		 903 aa  532  1e-149  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 902 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 932 aa  526  1e-148  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  38.45 
 
 		 903 aa  527  1e-148  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  37.68 
 
 		 926 aa  523  1e-147  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 936 aa  523  1e-147  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.7 
 
 		 893 aa  525  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  38.81 
 
 		 928 aa  524  1e-147  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 928 aa  523  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.66 
 
 		 931 aa  521  1e-146  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 924 aa  522  1e-146  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.07 
 
 		 928 aa  519  1e-146  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  38.71 
 
 		 928 aa  522  1e-146  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  38.6 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 932 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 932 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  37.8 
 
 		 932 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 929 aa  515  1e-144  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  36.95 
 
 		 978 aa  512  1e-144  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 891 aa  512  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  38.63 
 
 		 907 aa  509  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 930 aa  511  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.81 
 
 		 892 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  37.1 
 
 		 876 aa  507  9.999999999999999e-143  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 928 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 896 aa  503  1e-141  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0299  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 992 aa  504  1e-141  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  37.63 
 
 		 922 aa  506  1e-141  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  38.21 
 
 		 923 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  38.13 
 
 		 915 aa  499  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 926 aa  501  1e-140  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  36.27 
 
 		 910 aa  499  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 928 aa  502  1e-140  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 929 aa  500  1e-140  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 937 aa  498  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  39.77 
 
 		 908 aa  496  1e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 922 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 937 aa  497  1e-139  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  37.85 
 
 		 937 aa  499  1e-139  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 922 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 922 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  35.51 
 
 		 936 aa  496  1e-139  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 946 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1475  DNA polymerase I  38.23 
 
 		 893 aa  495  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 929 aa  496  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  38.74 
 
 		 941 aa  493  9.999999999999999e-139  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  38.95 
 
 		 929 aa  493  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 973 aa  494  9.999999999999999e-139  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 872 aa  491  1e-137  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  36.91 
 
 		 906 aa  492  1e-137  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  37.59 
 
 		 933 aa  491  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  37.92 
 
 		 911 aa  489  1e-136  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0419  DNA polymerase I  35.65 
 
 		 988 aa  486  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  37.38 
 
 		 931 aa  487  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  38.33 
 
 		 913 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  37.41 
 
 		 940 aa  489  1e-136  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  36.83 
 
 		 892 aa  484  1e-135  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2043  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 911 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.307294 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3109  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 972 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 950 aa  481  1e-134  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1892  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 930 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 945 aa  479  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3011  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 972 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.664853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3361  DNA polymerase I  36.33 
 
 		 909 aa  476  1e-133  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  decreased coverage  0.00788758  normal  0.41459 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  35.75 
 
 		 915 aa  479  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  37.58 
 
 		 945 aa  476  1e-133  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 922 aa  476  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>