More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_3125 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  51.24 
 
 		 931 aa  860    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  50 
 
 		 921 aa  816    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  53.42 
 
 		 872 aa  868    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  100 
 
 		 861 aa  1754    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  55.04 
 
 		 845 aa  911    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2445  DNA polymerase I  55.97 
 
 		 1015 aa  538  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.26 
 
 		 902 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.44 
 
 		 891 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 892 aa  512  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  37.29 
 
 		 870 aa  511  1e-143  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.27 
 
 		 892 aa  511  1e-143  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  36.48 
 
 		 892 aa  509  1e-143  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 943 aa  506  9.999999999999999e-143  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 936 aa  493  9.999999999999999e-139  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 884 aa  495  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 946 aa  494  9.999999999999999e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 872 aa  489  1e-137  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.67 
 
 		 892 aa  491  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  34.2 
 
 		 928 aa  490  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 888 aa  489  1e-136  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37 
 
 		 868 aa  487  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  35.93 
 
 		 923 aa  484  1e-135  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  36.06 
 
 		 907 aa  481  1e-134  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 846 aa  479  1e-134  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 936 aa  476  1e-133  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  35.36 
 
 		 915 aa  474  1e-132  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 891 aa  473  1e-132  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 888 aa  474  1e-132  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 945 aa  474  1e-132  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  38.37 
 
 		 843 aa  475  1e-132  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 893 aa  474  1e-132  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  34.49 
 
 		 850 aa  472  1.0000000000000001e-131  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 893 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  34.73 
 
 		 890 aa  467  9.999999999999999e-131  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  34.45 
 
 		 877 aa  466  9.999999999999999e-131  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 875 aa  467  9.999999999999999e-131  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 866 aa  467  9.999999999999999e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  34.05 
 
 		 876 aa  463  1e-129  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  36.17 
 
 		 876 aa  465  1e-129  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25960  DNA polymerase I  36.75 
 
 		 901 aa  464  1e-129  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  33.52 
 
 		 896 aa  464  1e-129  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  34.14 
 
 		 893 aa  461  9.999999999999999e-129  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  33.48 
 
 		 894 aa  459  9.999999999999999e-129  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 876 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  34.71 
 
 		 878 aa  462  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 876 aa  460  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 899 aa  461  9.999999999999999e-129  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 877 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  34.03 
 
 		 855 aa  459  1e-127  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  33.67 
 
 		 877 aa  456  1e-127  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  33.67 
 
 		 877 aa  458  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 877 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 891 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 891 aa  455  1.0000000000000001e-126  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 891 aa  454  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 877 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.01 
 
 		 883 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  33.64 
 
 		 878 aa  454  1.0000000000000001e-126  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  34.67 
 
 		 885 aa  455  1.0000000000000001e-126  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  33.41 
 
 		 903 aa  453  1.0000000000000001e-126  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  33.45 
 
 		 877 aa  456  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 877 aa  453  1.0000000000000001e-126  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 896 aa  452  1e-125  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2445  DNA polymerase I  34.88 
 
 		 877 aa  451  1e-125  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  35.91 
 
 		 879 aa  451  1e-125  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.7 
 
 		 892 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 879 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  34.69 
 
 		 957 aa  443  1e-123  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0389  DNA polymerase I  34.98 
 
 		 880 aa  442  1e-123  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  35.11 
 
 		 912 aa  445  1e-123  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2852  DNA polymerase I  34.61 
 
 		 906 aa  445  1e-123  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00117674  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 873 aa  444  1e-123  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  33.19 
 
 		 936 aa  445  1e-123  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.01 
 
 		 898 aa  445  1e-123  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  33.3 
 
 		 903 aa  445  1e-123  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1189  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 929 aa  441  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  32.11 
 
 		 861 aa  441  9.999999999999999e-123  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  33.85 
 
 		 953 aa  439  9.999999999999999e-123  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 885 aa  442  9.999999999999999e-123  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 929 aa  440  9.999999999999999e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  32.96 
 
 		 903 aa  439  1e-121  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  33.26 
 
 		 858 aa  437  1e-121  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  34.03 
 
 		 888 aa  437  1e-121  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  35.22 
 
 		 897 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  36.73 
 
 		 878 aa  437  1e-121  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.33 
 
 		 897 aa  439  1e-121  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 875 aa  437  1e-121  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2019  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 885 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.206031  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.56 
 
 		 897 aa  435  1e-120  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1226  DNA polymerase I  33.7 
 
 		 893 aa  430  1e-119  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.826859 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_13041  DNA polymerase I  31.63 
 
 		 976 aa  432  1e-119  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  31.56 
 
 		 963 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3011  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 920 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128275  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3057  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 920 aa  426  1e-118  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.826907 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3201  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 912 aa  427  1e-118  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  32.34 
 
 		 862 aa  425  1e-117  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3564  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 908 aa  424  1e-117  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0954216  normal  0.139495 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  32.41 
 
 		 896 aa  425  1e-117  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0713  DNA polymerase I  33.41 
 
 		 893 aa  424  1e-117  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3026  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 929 aa  424  1e-117  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.248484  normal  0.0929498 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>