More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0558 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  53.93 
 
 		 879 aa  961    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  54.27 
 
 		 879 aa  973    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  51.58 
 
 		 875 aa  932    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  55.6 
 
 		 902 aa  998    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  52.47 
 
 		 879 aa  930    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  100 
 
 		 885 aa  1822    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  54.38 
 
 		 879 aa  972    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  54.69 
 
 		 875 aa  977    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  54.97 
 
 		 879 aa  984    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 902 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  38.82 
 
 		 891 aa  597  1e-169  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  40.55 
 
 		 902 aa  597  1e-169  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  38.5 
 
 		 936 aa  595  1e-168  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 892 aa  594  1e-168  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  37.93 
 
 		 934 aa  582  1e-164  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 951 aa  569  1e-161  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 931 aa  566  1e-160  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.65 
 
 		 926 aa  568  1e-160  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 892 aa  564  1.0000000000000001e-159  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  38.12 
 
 		 934 aa  565  1.0000000000000001e-159  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 930 aa  561  1e-158  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  38.11 
 
 		 896 aa  561  1e-158  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  37.37 
 
 		 928 aa  560  1e-158  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  37.24 
 
 		 903 aa  560  1e-158  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  37.89 
 
 		 896 aa  558  1e-157  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 888 aa  555  1e-157  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  36.87 
 
 		 930 aa  558  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  37.47 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  36.56 
 
 		 912 aa  556  1e-157  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 939 aa  556  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  36.49 
 
 		 929 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  37 
 
 		 928 aa  558  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 928 aa  553  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 923 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 935 aa  553  1e-156  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  36.8 
 
 		 923 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  36.69 
 
 		 923 aa  553  1e-156  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 928 aa  554  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.47 
 
 		 929 aa  555  1e-156  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 928 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  37.57 
 
 		 928 aa  555  1e-156  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  37.39 
 
 		 928 aa  555  1e-156  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.46 
 
 		 891 aa  551  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 928 aa  552  1e-155  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 940 aa  549  1e-155  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 928 aa  552  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  36 
 
 		 937 aa  552  1e-155  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  37.11 
 
 		 908 aa  551  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  36.73 
 
 		 908 aa  549  1e-155  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 924 aa  550  1e-155  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 915 aa  549  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 932 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  36.12 
 
 		 943 aa  548  1e-154  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  37.49 
 
 		 903 aa  546  1e-154  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  37.53 
 
 		 939 aa  546  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  36.08 
 
 		 926 aa  546  1e-154  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 937 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  36.97 
 
 		 910 aa  546  1e-154  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 915 aa  546  1e-154  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.49 
 
 		 898 aa  548  1e-154  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 935 aa  546  1e-154  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 932 aa  548  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 928 aa  548  1e-154  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 932 aa  548  1e-154  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  37.25 
 
 		 902 aa  547  1e-154  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 915 aa  545  1e-153  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  37.67 
 
 		 906 aa  545  1e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 946 aa  544  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 945 aa  542  1e-153  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 915 aa  543  1e-153  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 934 aa  545  1e-153  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 915 aa  544  1e-153  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  38.1 
 
 		 928 aa  543  1e-153  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  37.06 
 
 		 913 aa  545  1e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  36.54 
 
 		 917 aa  545  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  36.86 
 
 		 922 aa  540  9.999999999999999e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  34.42 
 
 		 941 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 896 aa  540  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 917 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 926 aa  540  9.999999999999999e-153  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  35.77 
 
 		 942 aa  536  1e-151  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 953 aa  537  1e-151  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  36.45 
 
 		 921 aa  537  1e-151  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  35.58 
 
 		 934 aa  537  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  36.09 
 
 		 930 aa  538  1e-151  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  36.5 
 
 		 943 aa  537  1e-151  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  36.83 
 
 		 940 aa  539  1e-151  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>