More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_1341 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  100 
 
 		 879 aa  1779    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  81.23 
 
 		 879 aa  1455    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  49 
 
 		 902 aa  858    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  52.47 
 
 		 885 aa  930    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  60.64 
 
 		 875 aa  1065    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  59.14 
 
 		 879 aa  1081    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  81.46 
 
 		 879 aa  1462    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  60.75 
 
 		 875 aa  1102    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  81.23 
 
 		 879 aa  1457    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.05 
 
 		 892 aa  566  1e-160  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  36.66 
 
 		 891 aa  560  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 903 aa  556  1e-157  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 936 aa  558  1e-157  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 924 aa  544  1e-153  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.01 
 
 		 891 aa  540  9.999999999999999e-153  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  38.91 
 
 		 896 aa  541  9.999999999999999e-153  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 917 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 915 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 910 aa  536  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 915 aa  536  1e-151  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.61 
 
 		 913 aa  537  1e-151  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  37.81 
 
 		 926 aa  538  1e-151  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  37.75 
 
 		 902 aa  536  1e-151  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 915 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.38 
 
 		 902 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.38 
 
 		 902 aa  535  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  36.26 
 
 		 926 aa  535  1e-150  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.21 
 
 		 935 aa  532  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  38.61 
 
 		 898 aa  534  1e-150  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  35.82 
 
 		 915 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 896 aa  531  1e-149  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.65 
 
 		 928 aa  532  1e-149  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  34.87 
 
 		 935 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  35.2 
 
 		 892 aa  530  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 906 aa  527  1e-148  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 932 aa  528  1e-148  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.76 
 
 		 896 aa  526  1e-148  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 932 aa  528  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.89 
 
 		 932 aa  527  1e-148  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  34.32 
 
 		 905 aa  527  1e-148  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  35.4 
 
 		 908 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.59 
 
 		 930 aa  523  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  35.6 
 
 		 903 aa  525  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  34.83 
 
 		 928 aa  525  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  38.21 
 
 		 908 aa  522  1e-147  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.72 
 
 		 893 aa  525  1e-147  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  34.3 
 
 		 892 aa  521  1e-146  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  36.62 
 
 		 936 aa  522  1e-146  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  35.63 
 
 		 911 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 943 aa  519  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36 
 
 		 934 aa  518  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.82 
 
 		 893 aa  517  1.0000000000000001e-145  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 978 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.72 
 
 		 916 aa  517  1.0000000000000001e-145  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  36.19 
 
 		 928 aa  518  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 892 aa  517  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  36.08 
 
 		 928 aa  519  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  34.82 
 
 		 906 aa  514  1e-144  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  38.83 
 
 		 890 aa  513  1e-144  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  34.3 
 
 		 931 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  35.86 
 
 		 928 aa  515  1e-144  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  34.84 
 
 		 942 aa  514  1e-144  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 912 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.3 
 
 		 888 aa  511  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 979 aa  511  1e-143  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 929 aa  509  1e-143  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  34.29 
 
 		 907 aa  510  1e-143  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.42 
 
 		 892 aa  511  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 939 aa  511  1e-143  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  35.55 
 
 		 928 aa  512  1e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 930 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 951 aa  512  1e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 915 aa  509  1e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.88 
 
 		 931 aa  510  1e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 940 aa  511  1e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  34.22 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  34.21 
 
 		 923 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.31 
 
 		 934 aa  508  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 923 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.16 
 
 		 934 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 929 aa  506  9.999999999999999e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 926 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 926 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03934  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 933 aa  505  1e-141  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.540261  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 899 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  34.1 
 
 		 923 aa  506  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  34.96 
 
 		 899 aa  503  1e-141  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  33.99 
 
 		 926 aa  505  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>