More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene JJD26997_1620 on replicon NC_009707
Organism: Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009707  JJD26997_1620  DNA polymerase I  100 
 
 		 879 aa  1783    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0383  DNA polymerase I  96.47 
 
 		 879 aa  1731    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1341  DNA polymerase I  81.23 
 
 		 879 aa  1457    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  49.11 
 
 		 902 aa  850    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1705  DNA polymerase I  58.57 
 
 		 879 aa  1065    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0360  DNA polymerase I  96.25 
 
 		 879 aa  1727    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  53.93 
 
 		 885 aa  961    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  62 
 
 		 875 aa  1094    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0229  DNA polymerase I  60.41 
 
 		 875 aa  1106    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.61 
 
 		 892 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.21 
 
 		 891 aa  570  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  37.15 
 
 		 926 aa  551  1e-155  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1637  DNA polymerase I  37.07 
 
 		 936 aa  546  1e-154  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  35.92 
 
 		 903 aa  548  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  36.24 
 
 		 928 aa  540  9.999999999999999e-153  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  36.6 
 
 		 903 aa  537  1e-151  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  39.06 
 
 		 896 aa  537  1e-151  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 932 aa  537  1e-151  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 902 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 926 aa  535  1e-150  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 905 aa  533  1e-150  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 935 aa  533  1e-150  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 902 aa  534  1e-150  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  35.02 
 
 		 935 aa  530  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 930 aa  530  1e-149  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  37.13 
 
 		 896 aa  528  1e-148  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.68 
 
 		 917 aa  528  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 913 aa  527  1e-148  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.36 
 
 		 929 aa  528  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  34.48 
 
 		 891 aa  523  1e-147  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 888 aa  523  1e-147  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.5 
 
 		 929 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.63 
 
 		 896 aa  523  1e-147  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 892 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.83 
 
 		 898 aa  524  1e-147  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  38.32 
 
 		 908 aa  521  1e-146  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  34.61 
 
 		 928 aa  521  1e-146  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 902 aa  521  1e-146  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 943 aa  518  1.0000000000000001e-145  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  32.72 
 
 		 924 aa  516  1.0000000000000001e-145  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 892 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  35.29 
 
 		 910 aa  519  1.0000000000000001e-145  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.87 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  516  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 928 aa  517  1.0000000000000001e-145  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4978  DNA polymerase I  35.97 
 
 		 936 aa  514  1e-144  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.62 
 
 		 931 aa  516  1e-144  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 892 aa  514  1e-144  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 928 aa  514  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 930 aa  509  1e-143  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 926 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 926 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 923 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 926 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  35.23 
 
 		 892 aa  509  1e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 926 aa  510  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  38.38 
 
 		 890 aa  511  1e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  38.34 
 
 		 893 aa  511  1e-143  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 942 aa  510  1e-143  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  33.88 
 
 		 923 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  35.51 
 
 		 911 aa  510  1e-143  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  34.02 
 
 		 923 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  35.44 
 
 		 908 aa  512  1e-143  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.28 
 
 		 934 aa  507  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.12 
 
 		 934 aa  507  9.999999999999999e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 915 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  35.8 
 
 		 928 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 912 aa  506  9.999999999999999e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1853  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 940 aa  509  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0210712  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  34.72 
 
 		 915 aa  503  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  33.4 
 
 		 939 aa  504  1e-141  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.9 
 
 		 893 aa  506  1e-141  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4102  DNA polymerase I  35.84 
 
 		 930 aa  503  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000162392  normal  0.404063 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 934 aa  504  1e-141  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  34.82 
 
 		 928 aa  505  1e-141  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  34.5 
 
 		 915 aa  502  1e-140  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  34.48 
 
 		 926 aa  499  1e-140  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 906 aa  501  1e-140  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  34.51 
 
 		 915 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 922 aa  502  1e-140  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  35.53 
 
 		 939 aa  501  1e-140  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 926 aa  502  1e-140  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 916 aa  499  1e-140  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 915 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 922 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  33.77 
 
 		 908 aa  497  1e-139  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  35.15 
 
 		 935 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 921 aa  497  1e-139  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>