More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_3450 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013223  Dret_2404  DNA polymerase I  51.1 
 
 		 845 aa  847    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.405127 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3450  DNA polymerase I  100 
 
 		 931 aa  1906    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3125  DNA polymerase I  51.24 
 
 		 861 aa  852    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1713  DNA polymerase I  64.57 
 
 		 872 aa  1108    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1059  DNA polymerase I  55.14 
 
 		 921 aa  982    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.000233773  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2445  DNA polymerase I  66.97 
 
 		 1015 aa  719    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  38.56 
 
 		 892 aa  561  1e-158  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.98 
 
 		 891 aa  541  9.999999999999999e-153  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  37.43 
 
 		 892 aa  538  1e-151  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  37.73 
 
 		 892 aa  539  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  36.6 
 
 		 892 aa  535  1e-150  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  36 
 
 		 946 aa  532  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 902 aa  521  1e-146  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  38.49 
 
 		 895 aa  520  1e-146  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  35.74 
 
 		 891 aa  519  1.0000000000000001e-145  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 902 aa  517  1.0000000000000001e-145  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.96 
 
 		 903 aa  513  1e-144  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  36.62 
 
 		 903 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  34.08 
 
 		 872 aa  513  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 903 aa  510  1e-143  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  36.41 
 
 		 902 aa  510  1e-143  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  34.33 
 
 		 926 aa  503  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 888 aa  503  1e-141  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 936 aa  499  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  36.03 
 
 		 944 aa  501  1e-140  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  36.82 
 
 		 892 aa  501  1e-140  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  33.72 
 
 		 850 aa  502  1e-140  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  34.26 
 
 		 939 aa  498  1e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  34.87 
 
 		 878 aa  496  1e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  34.58 
 
 		 903 aa  497  1e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  37.14 
 
 		 870 aa  496  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  35.71 
 
 		 896 aa  495  9.999999999999999e-139  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  37.18 
 
 		 897 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  36.29 
 
 		 908 aa  494  9.999999999999999e-139  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 896 aa  494  9.999999999999999e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  37.34 
 
 		 878 aa  494  9.999999999999999e-139  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  35.06 
 
 		 945 aa  491  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1244  DNA polymerase I  35.9 
 
 		 902 aa  490  1e-137  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 894 aa  490  1e-137  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  36.11 
 
 		 868 aa  489  1e-136  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 891 aa  486  1e-136  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 877 aa  488  1e-136  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 877 aa  486  1e-136  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  34.85 
 
 		 877 aa  486  1e-136  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  37.28 
 
 		 846 aa  487  1e-136  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  36.21 
 
 		 897 aa  486  1e-136  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  34.89 
 
 		 855 aa  488  1e-136  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.72 
 
 		 893 aa  488  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  34.07 
 
 		 877 aa  483  1e-135  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 891 aa  486  1e-135  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 891 aa  485  1e-135  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 877 aa  483  1e-135  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 915 aa  484  1e-135  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  32.78 
 
 		 898 aa  483  1e-135  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  36.1 
 
 		 897 aa  486  1e-135  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  35.64 
 
 		 911 aa  483  1e-135  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  36.18 
 
 		 899 aa  485  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  34.63 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  34.93 
 
 		 888 aa  481  1e-134  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  33.74 
 
 		 893 aa  482  1e-134  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.19 
 
 		 917 aa  481  1e-134  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  35 
 
 		 877 aa  482  1e-134  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2867  DNA polymerase I  36.6 
 
 		 884 aa  480  1e-134  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.991449  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.45 
 
 		 913 aa  480  1e-134  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  35.03 
 
 		 943 aa  478  1e-133  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  35.52 
 
 		 885 aa  476  1e-133  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  35.05 
 
 		 915 aa  477  1e-133  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  37.02 
 
 		 873 aa  476  1e-133  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  35.41 
 
 		 924 aa  478  1e-133  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 937 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 915 aa  473  1e-132  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  34 
 
 		 893 aa  476  1e-132  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 896 aa  474  1e-132  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  35.76 
 
 		 907 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  33.51 
 
 		 932 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  34 
 
 		 937 aa  476  1e-132  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 899 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  35.46 
 
 		 899 aa  471  1.0000000000000001e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 896 aa  470  1.0000000000000001e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 915 aa  471  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  34.19 
 
 		 883 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 931 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  32.26 
 
 		 926 aa  464  1e-129  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.37 
 
 		 928 aa  465  1e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  34.36 
 
 		 929 aa  464  1e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 890 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  32.95 
 
 		 861 aa  464  1e-129  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 921 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1725  DNA polymerase I  34.04 
 
 		 875 aa  464  1e-129  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2025  DNA polymerase I  37.08 
 
 		 843 aa  466  1e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  33.91 
 
 		 921 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  34.16 
 
 		 922 aa  465  1e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  33.8 
 
 		 921 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.37 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 876 aa  461  9.999999999999999e-129  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.37 
 
 		 928 aa  461  9.999999999999999e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  33.69 
 
 		 935 aa  460  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>