More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Emin_0497 on replicon NC_010644
Organism: Elusimicrobium minutum Pei191



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010644  Emin_0497  DNA polymerase I  100 
 
 
862 aa  1763    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000090764  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  39.09 
 
 
883 aa  577  1.0000000000000001e-163  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37.13 
 
 
892 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  38.88 
 
 
888 aa  569  1e-161  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  39.19 
 
 
850 aa  570  1e-161  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  39.32 
 
 
868 aa  566  1e-160  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  38.37 
 
 
870 aa  564  1.0000000000000001e-159  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  39.48 
 
 
878 aa  556  1e-157  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.01 
 
 
891 aa  553  1e-156  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.82 
 
 
892 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  37.56 
 
 
872 aa  551  1e-155  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.56 
 
 
891 aa  552  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  38.14 
 
 
885 aa  550  1e-155  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  36.85 
 
 
903 aa  541  9.999999999999999e-153  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  36.64 
 
 
903 aa  538  1e-151  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.44 
 
 
892 aa  534  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.29 
 
 
892 aa  532  1e-150  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.56 
 
 
892 aa  534  1e-150  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  36.31 
 
 
903 aa  532  1e-149  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.45 
 
 
877 aa  531  1e-149  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  35.99 
 
 
877 aa  528  1e-148  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  35.87 
 
 
877 aa  529  1e-148  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  35.87 
 
 
877 aa  527  1e-148  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  37.05 
 
 
879 aa  526  1e-148  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.32 
 
 
877 aa  528  1e-148  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.76 
 
 
878 aa  529  1e-148  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  35.76 
 
 
891 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  35.76 
 
 
891 aa  525  1e-147  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  35.76 
 
 
891 aa  525  1e-147  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  35.76 
 
 
877 aa  525  1e-147  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  35.76 
 
 
877 aa  525  1e-147  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  35.65 
 
 
877 aa  521  1e-146  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  38.17 
 
 
866 aa  520  1e-146  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  37.84 
 
 
866 aa  521  1e-146  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  38.07 
 
 
866 aa  518  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  38.62 
 
 
855 aa  513  1e-144  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  35.61 
 
 
888 aa  513  1e-144  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  36.33 
 
 
928 aa  513  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  35.32 
 
 
885 aa  512  1e-143  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  35.04 
 
 
878 aa  512  1e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  36.01 
 
 
932 aa  512  1e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  36.1 
 
 
918 aa  510  1e-143  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  36.42 
 
 
929 aa  510  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  36.48 
 
 
912 aa  511  1e-143  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  36.17 
 
 
876 aa  507  9.999999999999999e-143  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  36.46 
 
 
876 aa  509  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  36.46 
 
 
876 aa  509  9.999999999999999e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4088  DNA polymerase I  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000478192  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  36.12 
 
 
928 aa  506  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  36.09 
 
 
930 aa  503  1e-141  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.11 
 
 
903 aa  506  1e-141  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  35.67 
 
 
926 aa  504  1e-141  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.15 
 
 
956 aa  505  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  35.77 
 
 
893 aa  503  1e-141  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  35.4 
 
 
935 aa  501  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.24 
 
 
929 aa  501  1e-140  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35.38 
 
 
951 aa  501  1e-140  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.89 
 
 
894 aa  499  1e-140  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  35.97 
 
 
923 aa  500  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  35.91 
 
 
898 aa  499  1e-139  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.71 
 
 
895 aa  499  1e-139  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  35.1 
 
 
910 aa  497  1e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  35.55 
 
 
896 aa  496  1e-139  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  35.15 
 
 
928 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  36.89 
 
 
902 aa  492  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4281  DNA polymerase I  35.15 
 
 
928 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.729451  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  36.1 
 
 
935 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4388  DNA polymerase I  35.04 
 
 
928 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00514081  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  37 
 
 
902 aa  494  9.999999999999999e-139  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4210  DNA polymerase I  35.04 
 
 
928 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.0026674  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4327  DNA polymerase I  35.15 
 
 
928 aa  495  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.44762 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  35.28 
 
 
922 aa  491  1e-137  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  34.87 
 
 
896 aa  491  1e-137  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0548  DNA polymerase I  35.84 
 
 
928 aa  490  1e-137  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.965006  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  35.39 
 
 
928 aa  491  1e-137  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  34.53 
 
 
873 aa  492  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  34.21 
 
 
896 aa  487  1e-136  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  35.05 
 
 
934 aa  489  1e-136  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  34.28 
 
 
922 aa  488  1e-136  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  34.91 
 
 
926 aa  483  1e-135  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  34.34 
 
 
916 aa  483  1e-135  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  34.74 
 
 
921 aa  486  1e-135  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4669  DNA polymerase I  34.34 
 
 
922 aa  486  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1247  DNA polymerase I  35.45 
 
 
888 aa  485  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00267055  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  35.55 
 
 
933 aa  486  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  35.87 
 
 
939 aa  486  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  34.74 
 
 
921 aa  486  1e-135  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  35.87 
 
 
890 aa  486  1e-135  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  35.57 
 
 
908 aa  484  1e-135  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  34.06 
 
 
922 aa  484  1e-135  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3997  DNA polymerase I  34.24 
 
 
922 aa  483  1e-135  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00125715  normal  0.0107257 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1736  DNA polymerase I  37.51 
 
 
879 aa  484  1e-135  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4485  DNA polymerase I  35 
 
 
921 aa  483  1e-135  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00194681  normal  0.0107032 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  35.14 
 
 
945 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>