More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1003 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1003  DNA polymerase I  100 
 
 
858 aa  1744    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.842634  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2846  DNA polymerase I  38.99 
 
 
943 aa  637    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.411951  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0200  DNA polymerase I  38.44 
 
 
937 aa  638    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.932691 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0048  DNA polymerase I  54.16 
 
 
861 aa  922    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3514  DNA polymerase A  40.68 
 
 
924 aa  664    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0675  DNA polymerase I  43.96 
 
 
829 aa  637    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  39.05 
 
 
935 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2689  DNA polymerase I  38.34 
 
 
937 aa  629  1e-179  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.283059  normal  0.26219 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1028  DNA polymerase I  38.23 
 
 
937 aa  628  1e-178  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.447207  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1504  DNA polymerase I  39.19 
 
 
915 aa  622  1e-177  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  38.83 
 
 
932 aa  622  1e-177  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0450  DNA polymerase I  38.97 
 
 
941 aa  616  1e-175  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  39.37 
 
 
928 aa  619  1e-175  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0221  DNA polymerase I  38.51 
 
 
973 aa  611  1e-173  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.978569  normal  0.324106 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  37.38 
 
 
911 aa  598  1e-169  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  38.19 
 
 
937 aa  593  1e-168  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  37.68 
 
 
929 aa  588  1e-166  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1612  DNA polymerase I  38.95 
 
 
902 aa  587  1e-166  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.4 
 
 
891 aa  584  1.0000000000000001e-165  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.78 
 
 
891 aa  585  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  38.3 
 
 
892 aa  569  1e-161  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  38.76 
 
 
892 aa  572  1e-161  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  38.96 
 
 
866 aa  569  1e-161  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  38.35 
 
 
893 aa  570  1e-161  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0278  DNA polymerase I  37.34 
 
 
945 aa  567  1e-160  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0080  DNA polymerase I  51.88 
 
 
944 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.432939  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  38.78 
 
 
870 aa  555  1e-157  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  39.16 
 
 
888 aa  558  1e-157  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  37.91 
 
 
892 aa  553  1e-156  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  37.18 
 
 
888 aa  553  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  38.49 
 
 
850 aa  550  1e-155  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  37.56 
 
 
883 aa  551  1e-155  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  36.97 
 
 
951 aa  547  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  36.22 
 
 
885 aa  543  1e-153  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  37.61 
 
 
868 aa  541  9.999999999999999e-153  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  35.84 
 
 
892 aa  536  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  36 
 
 
915 aa  533  1e-150  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  35.88 
 
 
903 aa  534  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2224  DNA polymerase I  36.49 
 
 
846 aa  532  1e-150  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.817961  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1403  DNA polymerase I  38.29 
 
 
878 aa  535  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  35.76 
 
 
892 aa  533  1e-150  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  35.67 
 
 
915 aa  529  1e-149  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  36.54 
 
 
915 aa  530  1e-149  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  36.54 
 
 
906 aa  530  1e-149  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0227  DNA polymerase I  36.22 
 
 
934 aa  531  1e-149  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.774927  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4227  DNA polymerase I  35.81 
 
 
929 aa  530  1e-149  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0477521  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  35.01 
 
 
897 aa  527  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  35.67 
 
 
915 aa  528  1e-148  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  36.8 
 
 
877 aa  526  1e-148  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  36.19 
 
 
939 aa  526  1e-148  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  35.2 
 
 
897 aa  528  1e-148  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.11 
 
 
911 aa  528  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  37.01 
 
 
908 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4517  DNA polymerase I  35.24 
 
 
929 aa  524  1e-147  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.21603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.56 
 
 
917 aa  525  1e-147  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  36.4 
 
 
877 aa  523  1e-147  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  34.64 
 
 
904 aa  521  1e-146  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  35.71 
 
 
891 aa  519  1e-146  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  36.03 
 
 
896 aa  521  1e-146  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4479  DNA polymerase I  35.98 
 
 
929 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578142  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.09 
 
 
913 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  35.71 
 
 
877 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  35.6 
 
 
891 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  35.6 
 
 
891 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  36.1 
 
 
896 aa  518  1.0000000000000001e-145  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  35.71 
 
 
877 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  36.09 
 
 
878 aa  518  1.0000000000000001e-145  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  35.5 
 
 
931 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  38.58 
 
 
855 aa  518  1.0000000000000001e-145  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  35.84 
 
 
877 aa  518  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2156  DNA polymerase I  38.21 
 
 
872 aa  519  1.0000000000000001e-145  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  35.71 
 
 
877 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  36.52 
 
 
877 aa  519  1.0000000000000001e-145  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  36.27 
 
 
918 aa  519  1.0000000000000001e-145  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2075  DNA polymerase I  35.45 
 
 
896 aa  514  1e-144  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000172322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0096  DNA-directed DNA polymerase  36.13 
 
 
933 aa  513  1e-144  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00741762  hitchhiker  0.000000822051 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  35.16 
 
 
932 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  35.4 
 
 
907 aa  515  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  37.43 
 
 
893 aa  513  1e-144  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  35.49 
 
 
877 aa  515  1e-144  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.78 
 
 
928 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  35.23 
 
 
928 aa  515  1e-144  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  35.14 
 
 
903 aa  513  1e-144  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  35.34 
 
 
930 aa  513  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  36.18 
 
 
930 aa  513  1e-144  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  36.22 
 
 
908 aa  514  1e-144  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  37.4 
 
 
898 aa  510  1e-143  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  35.83 
 
 
922 aa  512  1e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  34.78 
 
 
926 aa  512  1e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  37.62 
 
 
893 aa  511  1e-143  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  35.72 
 
 
922 aa  509  1e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  35.99 
 
 
945 aa  511  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  35.14 
 
 
922 aa  509  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.71 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.71 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.71 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  35.72 
 
 
921 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.71 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4231  DNA polymerase I  36.15 
 
 
928 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.000000696994  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4109  DNA polymerase I  35.67 
 
 
922 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000411128  normal  0.224079 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>