More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0780 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002620  TC0780  DNA polymerase I  100 
 
 		 866 aa  1785    Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3902  DNA polymerase I  37 
 
 		 892 aa  536  1e-151  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000292646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  37.74 
 
 		 891 aa  535  1e-150  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  37.16 
 
 		 891 aa  530  1e-149  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04860  DNA polymerase I  37.59 
 
 		 870 aa  529  1e-149  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.029838  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1024  DNA polymerase I  38.71 
 
 		 868 aa  529  1e-148  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  36.88 
 
 		 893 aa  525  1e-147  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2345  DNA polymerase I  35.67 
 
 		 895 aa  516  1.0000000000000001e-145  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 866 aa  516  1.0000000000000001e-145  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  36.51 
 
 		 893 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  36.34 
 
 		 892 aa  514  1e-144  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 896 aa  516  1e-144  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  35.66 
 
 		 896 aa  515  1e-144  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1599  DNA polymerase I  36.64 
 
 		 883 aa  516  1e-144  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2415  DNA polymerase I  37.33 
 
 		 888 aa  516  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0701371 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0365  DNA polymerase I  36.79 
 
 		 892 aa  515  1e-144  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  35.69 
 
 		 906 aa  510  1e-143  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  38.01 
 
 		 866 aa  512  1e-143  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  36.28 
 
 		 893 aa  510  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  37.09 
 
 		 892 aa  506  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1794  DNA polymerase type I  36.28 
 
 		 926 aa  503  1e-141  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  34.14 
 
 		 949 aa  505  1e-141  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  35.09 
 
 		 956 aa  505  1e-141  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3272  DNA polymerase I  35.93 
 
 		 877 aa  503  1e-141  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0345464  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2673  DNA polymerase I  35.43 
 
 		 878 aa  504  1e-141  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000968641  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  36.05 
 
 		 855 aa  502  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0358  DNA polymerase I  34.25 
 
 		 910 aa  500  1e-140  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.681988  normal  0.0403702 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4718  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4482  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 891 aa  496  1e-139  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4317  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 891 aa  496  1e-139  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4328  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 891 aa  497  1e-139  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4417  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 877 aa  496  1e-139  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1688  DNA polymerase I  35.17 
 
 		 940 aa  496  1e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  34.78 
 
 		 939 aa  498  1e-139  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4831  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.318585  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4702  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 877 aa  497  1e-139  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.7101300000000004e-28 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2798  DNA polymerase I  36.32 
 
 		 888 aa  497  1e-139  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0787  DNA polymerase I  35.13 
 
 		 876 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4712  DNA polymerase I  34.95 
 
 		 877 aa  495  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.14352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0541  DNA polymerase I  35.24 
 
 		 877 aa  496  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.375796  hitchhiker  0.00000000000567935 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4697  DNA polymerase I  35.06 
 
 		 877 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0439377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  35.1 
 
 		 850 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  33.3 
 
 		 915 aa  495  9.999999999999999e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0886  DNA polymerase I  34.77 
 
 		 894 aa  495  9.999999999999999e-139  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  33.73 
 
 		 923 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  33.7 
 
 		 899 aa  491  1e-137  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  35.57 
 
 		 892 aa  490  1e-137  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 923 aa  491  1e-137  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 923 aa  492  1e-137  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 937 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2042  DNA polymerase I  34.05 
 
 		 937 aa  489  1e-136  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.782294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  33.37 
 
 		 913 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  33.9 
 
 		 924 aa  487  1e-136  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  33.63 
 
 		 903 aa  489  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 897 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  33.59 
 
 		 897 aa  484  1e-135  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  35.31 
 
 		 902 aa  484  1e-135  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  34.86 
 
 		 902 aa  483  1e-135  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  34.26 
 
 		 906 aa  481  1e-134  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  33.56 
 
 		 879 aa  481  1e-134  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3261  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 911 aa  481  1e-134  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155363 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  34.99 
 
 		 946 aa  480  1e-134  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  34.26 
 
 		 899 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  34.36 
 
 		 898 aa  476  1e-133  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  33.55 
 
 		 917 aa  478  1e-133  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 897 aa  477  1e-133  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  32.98 
 
 		 939 aa  478  1e-133  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1747  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 876 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.724051  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1917  DNA polymerase I  33.96 
 
 		 890 aa  476  1e-133  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100077  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 917 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 917 aa  478  1e-133  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1781  DNA polymerase I  34.76 
 
 		 876 aa  476  1e-133  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 913 aa  478  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2017  DNA polymerase I  34.65 
 
 		 866 aa  478  1e-133  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 917 aa  476  1e-133  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  34.26 
 
 		 899 aa  478  1e-133  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 917 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 917 aa  476  1e-133  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1391  DNA-directed DNA polymerase I  34.69 
 
 		 903 aa  476  1e-132  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.958554  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  34.62 
 
 		 930 aa  474  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  33 
 
 		 907 aa  474  1e-132  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0554  DNA polymerase A  33.63 
 
 		 903 aa  475  1e-132  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.266566  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 939 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  33.62 
 
 		 928 aa  475  1e-132  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 912 aa  474  1e-132  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1254  DNA polymerase I  33.26 
 
 		 876 aa  471  1.0000000000000001e-131  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  33.52 
 
 		 917 aa  472  1.0000000000000001e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  32.78 
 
 		 905 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1841  DNA polymerase I  36.13 
 
 		 885 aa  471  1.0000000000000001e-131  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0941024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  35.83 
 
 		 936 aa  470  1.0000000000000001e-131  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2468  DNA polymerase I  35.54 
 
 		 873 aa  470  1.0000000000000001e-131  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.095823  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1421  DNA polymerase I  34.15 
 
 		 896 aa  472  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0115482  hitchhiker  0.000000064495 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1172  DNA-directed DNA polymerase I  35.13 
 
 		 903 aa  470  1.0000000000000001e-131  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.813063  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  33.65 
 
 		 979 aa  469  9.999999999999999e-131  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1200  DNA polymerase I  34.18 
 
 		 903 aa  466  9.999999999999999e-131  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  33.84 
 
 		 926 aa  468  9.999999999999999e-131  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  33.76 
 
 		 935 aa  468  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 928 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.81 
 
 		 931 aa  468  9.999999999999999e-131  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  34.27 
 
 		 932 aa  462  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>