51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_1482 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  94.35 
 
 		 726 aa  1031    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  94.37 
 
 		 377 aa  651    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  94.35 
 
 		 726 aa  1031    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 422 aa  829    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 567 aa  1164    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  100 
 
 		 726 aa  1159    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  52.64 
 
 		 693 aa  584  1.0000000000000001e-165  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  40.1 
 
 		 704 aa  365  1e-100  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  33.45 
 
 		 650 aa  281  3e-74  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  96.1 
 
 		 154 aa  278  2e-73  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  32.47 
 
 		 652 aa  275  2.0000000000000002e-72  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  32.12 
 
 		 653 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  32.12 
 
 		 653 aa  258  2e-67  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  31.48 
 
 		 644 aa  258  2e-67  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  32.58 
 
 		 644 aa  253  7e-66  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  31.54 
 
 		 646 aa  246  9.999999999999999e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  30.72 
 
 		 662 aa  239  1e-61  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  30.62 
 
 		 647 aa  237  4e-61  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  30.45 
 
 		 644 aa  234  4.0000000000000004e-60  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  26.33 
 
 		 361 aa  77  0.0000000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  23.72 
 
 		 897 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  23.72 
 
 		 897 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  23.4 
 
 		 897 aa  55.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  20.89 
 
 		 915 aa  53.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 926 aa  51.2  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  23.28 
 
 		 913 aa  50.8  0.00006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  21.9 
 
 		 923 aa  50.8  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  27.97 
 
 		 908 aa  49.7  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  23.4 
 
 		 899 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  27.56 
 
 		 913 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  20.89 
 
 		 926 aa  48.5  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4827  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  48.5  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00421235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3769  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  48.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.662383  hitchhiker  0.00614094 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  27.56 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3243  DNA polymerase I  21.09 
 
 		 917 aa  47.8  0.0005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0154529 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  20.95 
 
 		 917 aa  47.4  0.0007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  21.75 
 
 		 939 aa  46.6  0.001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  22.84 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  22.84 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  22.84 
 
 		 917 aa  45.8  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 907 aa  45.4  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 922 aa  44.3  0.006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 946 aa  44.3  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  26.05 
 
 		 922 aa  44.3  0.006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  25.35 
 
 		 906 aa  43.9  0.008  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1079  DNA polymerase I  28.35 
 
 		 836 aa  43.9  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.26558  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>