19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0371 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 154 aa  319  9.999999999999999e-87  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  98.7 
 
 		 726 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  98.7 
 
 		 726 aa  318  1.9999999999999998e-86  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  96.1 
 
 		 567 aa  278  2e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  96.1 
 
 		 726 aa  276  6e-74  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  96.1 
 
 		 422 aa  276  1e-73  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 693 aa  164  5e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  44.2 
 
 		 652 aa  120  8e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  42.59 
 
 		 704 aa  117  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 650 aa  117  7.999999999999999e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  41.1 
 
 		 644 aa  104  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  42.47 
 
 		 644 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  42.47 
 
 		 647 aa  103  1e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  42.34 
 
 		 644 aa  102  2e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 653 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  37.82 
 
 		 653 aa  102  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  39.61 
 
 		 646 aa  101  3e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  38.31 
 
 		 662 aa  100  5e-21  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  30.95 
 
 		 361 aa  52  0.000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>