More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dred_1191 on replicon NC_009253
Organism: Desulfotomaculum reducens MI-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  55.2 
 
 		 646 aa  684    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  53.35 
 
 		 662 aa  679    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  53.37 
 
 		 644 aa  684    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  52.43 
 
 		 653 aa  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  57.23 
 
 		 644 aa  739    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  65.9 
 
 		 652 aa  872    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  52.43 
 
 		 653 aa  672    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  53.78 
 
 		 647 aa  681    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  54.77 
 
 		 644 aa  709    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 650 aa  1350    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  33 
 
 		 693 aa  348  2e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 		 726 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  32.97 
 
 		 726 aa  341  2e-92  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  33.15 
 
 		 726 aa  340  5.9999999999999996e-92  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  31.35 
 
 		 704 aa  296  8e-79  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  32.58 
 
 		 567 aa  260  7e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  31.13 
 
 		 422 aa  169  1e-40  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  32.53 
 
 		 377 aa  157  5.0000000000000005e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  40.76 
 
 		 154 aa  113  1.0000000000000001e-23  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  27.95 
 
 		 361 aa  82.4  0.00000000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  24.95 
 
 		 930 aa  75.1  0.000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0678  DNA polymerase I  23.33 
 
 		 1016 aa  73.9  0.000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.80797  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0069  DNA polymerase I  25.19 
 
 		 953 aa  73.6  0.00000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.512123  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1501  DNA polymerase I  24.34 
 
 		 1024 aa  71.2  0.00000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.318672  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2014  DNA polymerase I  26.56 
 
 		 875 aa  67.8  0.0000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.0000063172  unclonable  0.00000000000000410772 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2399  DNA polymerase I  26.51 
 
 		 1047 aa  66.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.245921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1080  DNA polymerase I  25.48 
 
 		 886 aa  65.5  0.000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1330  DNA polymerase I  22.9 
 
 		 879 aa  65.5  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.17915  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3536  DNA polymerase I  23.46 
 
 		 1060 aa  63.5  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.139482  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3185  fused DNA polymerase 5'->3' exonuclease and 3'->5' polymerase and 3'->5' exonuclease  31.88 
 
 		 938 aa  63.5  0.00000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.994376  normal  0.149667 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0558  DNA polymerase I superfamily protein  23.9 
 
 		 908 aa  62.8  0.00000002  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.101615  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  24.05 
 
 		 994 aa  62.8  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2250  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.177355  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1962  DNA polymerase I  39.33 
 
 		 866 aa  62.8  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12990  DNA polymerase I  28.14 
 
 		 878 aa  62  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.000153824  normal  0.116301 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0044  DNA polymerase I  21.59 
 
 		 939 aa  62.4  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00167336  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2471  DNA polymerase I  26.1 
 
 		 1047 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.195384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2694  DNA polymerase I  26.1 
 
 		 1047 aa  62.4  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08230  DNA polymerase I  27.91 
 
 		 885 aa  61.6  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.919287 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3372  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 899 aa  60.8  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0398668  normal  0.0449106 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0015  DNA polymerase I  23.02 
 
 		 928 aa  60.8  0.00000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.853211  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3714  DNA polymerase I  24.76 
 
 		 930 aa  60.8  0.00000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00250516  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1683  DNA polymerase I  24.06 
 
 		 929 aa  60.8  0.00000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.569036  normal  0.718828 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1841  DNA polymerase I  22.41 
 
 		 936 aa  60.1  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.721717  normal  0.294412 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0280  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 916 aa  60.5  0.0000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  22.98 
 
 		 942 aa  59.7  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  26.21 
 
 		 906 aa  59.7  0.0000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 956 aa  59.3  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  28.12 
 
 		 917 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  28.91 
 
 		 913 aa  59.7  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  37.5 
 
 		 931 aa  58.5  0.0000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0002  DNA polymerase I  24.33 
 
 		 968 aa  58.9  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00572  DNA polymerase I  28.12 
 
 		 930 aa  58.5  0.0000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1711  DNA polymerase I  22.18 
 
 		 943 aa  58.9  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.338945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001917  DNA polymerase I  23.89 
 
 		 928 aa  58.2  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.0000349897  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2377  DNA polymerase I  21.53 
 
 		 1000 aa  58.5  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0421438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  29.46 
 
 		 582 aa  58.5  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0105  DNA polymerase I  21.37 
 
 		 979 aa  58.2  0.0000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.1277 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0357  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 1010 aa  58.2  0.0000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.577843 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  26.77 
 
 		 932 aa  58.2  0.0000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0453  DNA polymerase I  24.7 
 
 		 1014 aa  57.8  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4493  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3655  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.498636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3872  DNA polymerase I  26.62 
 
 		 917 aa  57.8  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2744  DNA polymerase I  23.12 
 
 		 1043 aa  57.8  0.0000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.560241 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0344  DNA polymerase I  24.6 
 
 		 925 aa  57.4  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  24.19 
 
 		 915 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1104  DNA polymerase I  27.03 
 
 		 912 aa  56.6  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0123  DNA polymerase I  24.74 
 
 		 979 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.389931  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1441  DNA polymerase I  21.43 
 
 		 850 aa  56.6  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0194  DNA polymerase I  24.01 
 
 		 953 aa  57  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1092  DNA polymerase I  28.69 
 
 		 932 aa  56.6  0.000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.416306  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  24.19 
 
 		 915 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3945  DNA polymerase I  26.3 
 
 		 978 aa  57  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  25.13 
 
 		 946 aa  57  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0016  DNA polymerase I  24 
 
 		 928 aa  57  0.000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0119  DNA polymerase I  24.74 
 
 		 978 aa  56.6  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  26.21 
 
 		 896 aa  55.8  0.000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0270  DNA polymerase I  24.6 
 
 		 921 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0056  DNA polymerase I  25.1 
 
 		 935 aa  55.8  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  24.19 
 
 		 915 aa  56.6  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  27.34 
 
 		 934 aa  55.8  0.000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3145  DNA polymerase I  34.23 
 
 		 899 aa  55.8  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0093  DNA-directed DNA polymerase  23.93 
 
 		 923 aa  56.2  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00183207  normal  0.0262318 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  24.19 
 
 		 915 aa  55.8  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2218  DNA polymerase I  26.6 
 
 		 917 aa  55.8  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  23.3 
 
 		 899 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0137  DNA polymerase I  24.42 
 
 		 976 aa  55.8  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.909529  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7357  DNA polymerase I  29.84 
 
 		 1020 aa  55.8  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.409782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  28.77 
 
 		 897 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0848  DNA polymerase I  30.65 
 
 		 1032 aa  55.1  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0625  DNA polymerase I  24.24 
 
 		 937 aa  55.1  0.000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.480617 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  26.57 
 
 		 951 aa  55.1  0.000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0102  DNA polymerase I  24.35 
 
 		 918 aa  55.1  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.758898  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  24.15 
 
 		 934 aa  55.1  0.000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5325  DNA polymerase I  21.45 
 
 		 947 aa  54.7  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  29.03 
 
 		 939 aa  54.7  0.000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  26 
 
 		 891 aa  54.7  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  23.01 
 
 		 908 aa  55.1  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0060  DNA polymerase I  23.05 
 
 		 945 aa  54.7  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0959551  hitchhiker  0.000000934143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>