50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1826 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_1204  DNA-directed DNA polymerase  52.41 
 
 		 693 aa  743    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0424  phage-related DNA polymerase  94.78 
 
 		 422 aa  722    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1826  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 726 aa  1487    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1407  DNA-directed DNA polymerase  96.17 
 
 		 377 aa  679    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1206  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 726 aa  1487    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1176  phage-related DNA polymerase  94.9 
 
 		 726 aa  1353    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0140258  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1482  phage-related DNA polymerase  94.35 
 
 		 567 aa  1030    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3411  DNA-directed DNA polymerase  42.41 
 
 		 704 aa  501  1e-140  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0320259  hitchhiker  0.00284905 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1191  DNA-directed DNA polymerase  33.38 
 
 		 650 aa  360  4e-98  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0554061  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3062  DNA-directed DNA polymerase  32.47 
 
 		 652 aa  342  2e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1058  DNA-directed DNA polymerase  31.52 
 
 		 653 aa  323  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1039  DNA-directed DNA polymerase  31.52 
 
 		 653 aa  323  9.000000000000001e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.74176  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1234  DNA-directed DNA polymerase  32.01 
 
 		 644 aa  321  3e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000117572  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0371  DNA-directed DNA polymerase  98.7 
 
 		 154 aa  318  3e-85  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1473  DNA polymerase I  31.01 
 
 		 644 aa  313  7.999999999999999e-84  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0074  family A DNA-dependent DNA polymerase  31.29 
 
 		 646 aa  306  1.0000000000000001e-81  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2856  DNA-directed DNA polymerase  31.56 
 
 		 647 aa  301  2e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100854  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1100  family A DNA-dependent DNA polymerase  30.61 
 
 		 662 aa  298  3e-79  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0506694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0377  DNA polymerase I  30.88 
 
 		 644 aa  290  8e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.052117  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00793  phage-related DNA polymerase  25.76 
 
 		 361 aa  80.9  0.00000000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00479153  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2550  DNA polymerase I  24.27 
 
 		 897 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1310  DNA polymerase I  24.27 
 
 		 897 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0646718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2646  DNA polymerase I  24.12 
 
 		 897 aa  54.3  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00630  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 908 aa  51.6  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4419  DNA polymerase I  22.84 
 
 		 915 aa  48.9  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.251272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2834  DNA polymerase I  26.89 
 
 		 913 aa  48.9  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2455  DNA polymerase I  23.26 
 
 		 899 aa  48.1  0.0006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0573873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  23.03 
 
 		 926 aa  47.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  26.77 
 
 		 582 aa  47.8  0.0008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6788  DNA polymerase I  26.77 
 
 		 913 aa  47  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0147599  hitchhiker  0.00000170009 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 926 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 923 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3813  DNA polymerase I  25.87 
 
 		 939 aa  45.8  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.273799  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 923 aa  46.2  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  22.64 
 
 		 923 aa  46.6  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2453  DNA polymerase I  28.67 
 
 		 907 aa  45.8  0.003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  26.06 
 
 		 906 aa  45.4  0.004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2669  DNA polymerase I  24.48 
 
 		 922 aa  45.1  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.48078  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3317  DNA polymerase I  24.48 
 
 		 922 aa  45.1  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.397865  normal  0.106648 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  25.35 
 
 		 903 aa  45.1  0.005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0154  DNA polymerase I  27.27 
 
 		 931 aa  44.7  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  25.3 
 
 		 918 aa  44.7  0.007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 921 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 921 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3906  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 922 aa  44.3  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000887796  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  23.08 
 
 		 935 aa  44.3  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  27.46 
 
 		 908 aa  43.9  0.009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>