More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3166 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3166  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 		 582 aa  1165    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0971  DNA-directed DNA polymerase  35.35 
 
 		 583 aa  334  2e-90  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1349  DNA-directed DNA polymerase  37.16 
 
 		 682 aa  308  2.0000000000000002e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.201208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2534  DNA polymerase I  31.81 
 
 		 926 aa  287  2.9999999999999996e-76  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0540  DNA polymerase I  33.28 
 
 		 936 aa  283  6.000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.560108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0718  DNA polymerase I  35 
 
 		 951 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0655  DNA polymerase I  34.11 
 
 		 944 aa  279  1e-73  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2835  DNA polymerase I  34.31 
 
 		 893 aa  278  2e-73  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333743  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0179  DNA polymerase A  33.72 
 
 		 924 aa  276  1.0000000000000001e-72  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0536  DNA polymerase I  33.66 
 
 		 946 aa  275  2.0000000000000002e-72  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1617  DNA polymerase I  30.92 
 
 		 949 aa  273  8.000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.310116  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1349  DNA polymerase I  34.32 
 
 		 924 aa  273  9e-72  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.38206  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0601  DNA-directed DNA polymerase  30.97 
 
 		 587 aa  271  2.9999999999999997e-71  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0473  DNA polymerase I  32.74 
 
 		 943 aa  270  4e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1172  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 893 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2573  DNA polymerase I  33.22 
 
 		 892 aa  269  1e-70  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000431166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0494  DNA polymerase I  33.11 
 
 		 950 aa  269  1e-70  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.958979 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2692  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 899 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.700333  hitchhiker  0.00010677 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1283  DNA polymerase I  31.18 
 
 		 893 aa  268  2e-70  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3011  DNA polymerase I  33.07 
 
 		 957 aa  268  2e-70  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3094  DNA polymerase I  36.04 
 
 		 899 aa  268  2e-70  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0087  DNA polymerase I  36.58 
 
 		 903 aa  264  3e-69  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02590  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 956 aa  264  4e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0044  DNA polymerase I  36.25 
 
 		 911 aa  263  4.999999999999999e-69  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.812891  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0077  DNA polymerase I  32.22 
 
 		 896 aa  262  1e-68  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.586313  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4214  DNA polymerase I  30.29 
 
 		 939 aa  262  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.305733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0712  DNA polymerase I  34.09 
 
 		 939 aa  261  3e-68  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0765  DNA polymerase I  33.17 
 
 		 930 aa  261  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0073  DNA polymerase I  34.4 
 
 		 926 aa  260  4e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.800167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3967  DNA polymerase I  34.43 
 
 		 931 aa  260  6e-68  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000137661  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0568  DNA polymerase I  33.92 
 
 		 905 aa  260  6e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1938  DNA polymerase I  32.89 
 
 		 945 aa  259  8e-68  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.632824  normal  0.0549057 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0592  DNA polymerase I  35.04 
 
 		 891 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000108203  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2409  DNA polymerase I  34.07 
 
 		 934 aa  258  3e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000078353  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2624  DNA polymerase I  33.6 
 
 		 934 aa  258  3e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.972131  normal  0.775806 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0021  DNA polymerase I  32.42 
 
 		 902 aa  257  4e-67  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0163  DNA polymerase A  34.17 
 
 		 906 aa  257  5e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0360  DNA polymerase I  29.08 
 
 		 898 aa  257  5e-67  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3943  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 918 aa  256  7e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000101899  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00016  DNA polymerase I  32.01 
 
 		 930 aa  256  8e-67  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1992  DNA polymerase I  32.11 
 
 		 902 aa  256  9e-67  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0558  DNA polymerase I  35.14 
 
 		 885 aa  256  9e-67  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.851525  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2803  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 994 aa  255  1.0000000000000001e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.293267  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4887  DNA polymerase I  33.83 
 
 		 934 aa  255  1.0000000000000001e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.00000312634  hitchhiker  0.0000015928 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3620  DNA polymerase I  32.7 
 
 		 921 aa  256  1.0000000000000001e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00307404  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0021  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 932 aa  255  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00121039  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4195  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 932 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.00580719  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1148  DNA-directed DNA polymerase  33.82 
 
 		 937 aa  255  2.0000000000000002e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.725762  normal  0.433626 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2421  DNA polymerase I  33.12 
 
 		 904 aa  255  2.0000000000000002e-66  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0819967  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0323  hypothetical protein  31.77 
 
 		 936 aa  254  2.0000000000000002e-66  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.875781 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0023  DNA polymerase I  32.58 
 
 		 932 aa  255  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.0000103572  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0541  DNA polymerase I  33.33 
 
 		 891 aa  254  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2573  DNA polymerase I  35.73 
 
 		 906 aa  254  4.0000000000000004e-66  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1062  DNA polymerase I  33 
 
 		 934 aa  254  4.0000000000000004e-66  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0113  DNA polymerase I  32.36 
 
 		 896 aa  254  4.0000000000000004e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2230  DNA polymerase I  33.81 
 
 		 946 aa  252  1e-65  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0099  DNA polymerase I  31.72 
 
 		 896 aa  252  1e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6293  DNA polymerase I  35.16 
 
 		 917 aa  252  1e-65  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0140  DNA polymerase I  33.44 
 
 		 915 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0123  DNA polymerase I  33.5 
 
 		 915 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.121989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5105  DNA polymerase I  34.59 
 
 		 915 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186109 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2983  DNA polymerase I  33.01 
 
 		 892 aa  251  2e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2909  DNA polymerase I  34.72 
 
 		 932 aa  251  2e-65  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.033314  normal  0.843304 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0882  DNA polymerase I  34.21 
 
 		 855 aa  252  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2546  DNA polymerase I  34 
 
 		 923 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.809446  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4164  DNA polymerase I  33.58 
 
 		 928 aa  251  3e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0170728  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0353  DNA polymerase I  34 
 
 		 926 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0319  DNA polymerase I  34 
 
 		 926 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1696  DNA polymerase I  34 
 
 		 926 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2403  DNA polymerase I  34 
 
 		 923 aa  251  3e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2764  DNA polymerase I  32.33 
 
 		 935 aa  251  3e-65  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3657  DNA polymerase I  30.94 
 
 		 946 aa  251  3e-65  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3415  DNA polymerase I  34.14 
 
 		 965 aa  251  3e-65  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.00208167  normal  0.0804526 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1500  DNA polymerase I  34 
 
 		 926 aa  251  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.530484  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0605  DNA polymerase I  33.84 
 
 		 926 aa  250  4e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.503998  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3941  DNA polymerase I  35.49 
 
 		 924 aa  250  5e-65  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2860  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 912 aa  250  5e-65  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.129264  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72490  DNA polymerase I  35.98 
 
 		 913 aa  250  5e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.579087  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0851  DNA polymerase I  33.84 
 
 		 923 aa  250  6e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.280687  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0346  DNA polymerase I  32.68 
 
 		 892 aa  250  6e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.335360000000001e-24 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0138  DNA polymerase I  34.13 
 
 		 915 aa  250  6e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03749  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.000312835  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4123  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000018502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03698  hypothetical protein  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.000500829  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4152  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000213441  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4246  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000118244  normal  0.166094 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4337  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.0000000000947993  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1429  DNA polymerase I  31.44 
 
 		 942 aa  249  8e-65  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4382  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  249  8e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000170331  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3590  DNA polymerase I  32.85 
 
 		 936 aa  249  9e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000120816 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0873  DNA polymerase I  32.79 
 
 		 941 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.504211  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2435  DNA polymerase I  34.9 
 
 		 937 aa  249  1e-64  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.326826  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5306  DNA polymerase I  35.35 
 
 		 928 aa  248  2e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000330989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1645  DNA polymerase A  31.8 
 
 		 945 aa  248  2e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1096  DNA polymerase I  31.53 
 
 		 963 aa  248  3e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0889452  normal  0.949667 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0541  DNA polymerase I  32.9 
 
 		 908 aa  247  3e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4290  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 921 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000095151  hitchhiker  0.000000056057 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3905  DNA polymerase I  34.98 
 
 		 922 aa  247  4e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0001632  normal  0.292845 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4345  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 935 aa  247  4e-64  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000790678  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0053  DNA polymerase I  33.89 
 
 		 921 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000915793  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>